应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » IBRION = 5
61/1返回列表
查看: 1897  |  回复: 5
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

4010808

木虫 (小有名气)

[求助] IBRION = 5

请问IBRION=5的输出结果应如何解读，例如：
DYNMAT
  ------
      1   32    3
  12.011
     1    1  0.0500  0.0000  0.
*** *** ***
*** *** ***
论坛上说number of atom types (1) , number of atoms (of each type) (32), number of degrees of freedom (3)
atomic mass (es for each type)
#of the degree of freedom (1), #of the displacement (1) , displacement stepwidth (x,y,z) (POTIM 0.0 0.0)
那么对于后面的***的矩阵应如何理解？并且如何对角化得到频率。谢谢
回复此楼

» 猜你喜欢
1楼 2011-08-21 10:59:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cenwanglai

荣誉版主 (知名作家)

老和山猥琐派九段

优秀版主
★ ★
youzhizhe(金币+2): 谢谢交流。 2011-08-24 10:38:40
引用回帖:
1楼: Originally posted by 4010808 at 2011-08-21 10:59:56:
请问IBRION=5的输出结果应如何解读，例如：
DYNMAT
  ------
      1   32    3
  12.011
     1    1  0.0500  0.0000  0.
*** *** ***
*** *** ***
论坛上说number of atom types (1) , number of  ...

结果中不是直接有频率吗？

用“1 f”所搜就看到了。

矩阵对角化，这个我不清楚如何从OUTCAR中抠出矩阵来用脚本对角化。可能是用对vtstool角化脚本直接处理OUTCAR或者EIGENVAL文件？查查脚本代码看看。
赞一下(1人) 回复此楼
2楼2011-08-21 15:45:41
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

dxcharlary

专家顾问 (职业作家)
★
cenwanglai(金币+1): 谢谢参与讨论 2011-08-21 17:08:32
引用回帖:
2楼: Originally posted by cenwanglai at 2011-08-21 15:45:41:
结果中不是直接有频率吗？

用“1 f”所搜就看到了。

矩阵对角化，这个我不清楚如何从OUTCAR中抠出矩阵来用脚本对角化。可能是用对vtstool角化脚本直接处理OUTCAR或者EIGENVAL文件？查查脚本代码看看。

他这个不是OUTCAR里面的数据，是DYMAT文件里面的。不过不清楚为什么32个原子，只有3个自由度。
赞一下(1人) 回复此楼
3楼2011-08-21 17:04:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cenwanglai

荣誉版主 (知名作家)

老和山猥琐派九段

优秀版主
★
youzhizhe(金币+1): 谢谢交流。 2011-08-24 10:38:51
引用回帖:
3楼: Originally posted by dxcharlary at 2011-08-21 17:04:54:
他这个不是OUTCAR里面的数据，是DYMAT文件里面的。不过不清楚为什么32个原子，只有3个自由度。

做的是vtstool里面的dynamical matrix计算？

一般的IBRION = 5 计算没有 DYMAT文件输出呢。

[ Last edited by cenwanglai on 2011-8-21 at 17:07 ]
赞一下(1人) 回复此楼
4楼2011-08-21 17:06:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

fengangelo

禁虫 (小有名气)
★ ★
youzhizhe(金币+2): 谢谢交流。 2011-08-24 10:38:58
4010808(金币+1): 2011-08-24 10:40:10
本帖内容被屏蔽
5楼2011-08-23 19:47:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cenwanglai

荣誉版主 (知名作家)

老和山猥琐派九段

优秀版主
★ ★
youzhizhe(金币+2): 谢谢交流。 2011-08-24 15:54:17
引用回帖:
5楼: Originally posted by fengangelo at 2011-08-23 19:47:54:
我在IBRION=5算频率是为了找复数的频率（虚频）然后确定是不是过渡态。
我有4个原子设置为可以relax，其他的固定。会显示总共有12个degree of freedom
这样grep THz OUTCAR会得到12个频率

每个自由度对应一个频率。
4个原子，每个原子三个自由度，一共12个自由度。所以12个频率是正确的。
赞一下(1人) 回复此楼
6楼2011-08-24 12:33:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 4010808 的主题更新
61/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 有时候，自然基金真的不能太认真 （我的申报经验） +9 majunge000 2026-08-11 11/550 2026-08-15 23:20 by botar
[基金申请] filecode=后面第一个是大写字母 +6 wangze12014 2026-08-14 7/350 2026-08-15 20:12 by gltch
[基金申请] filecode +8 cratir 2026-08-14 12/600 2026-08-15 18:08 by zyfgau
[基金申请] 各位道友，我要去昆明玩几天，回来见。 +7 Tide man 2026-08-14 8/400 2026-08-15 01:11 by arzu_hma
[基金申请] 咱们一起用铁证分析2026国家社科基金中标与否 +7 启萌科技 2026-08-12 22/1100 2026-08-14 23:45 by Noways
[基金申请] 是这周出结果还是下周出结果？ +4 yuleib84 2026-08-11 4/200 2026-08-14 23:05 by lfy8008
[基金申请] 应该是93bebmhtak前后十一个字符比较关键 +23 Lanmanbaby 2026-08-09 37/1850 2026-08-14 13:40 by Equinoxhua
[硕博家园] 请教兼职经验 +3 是阿文鸭 2026-08-09 3/150 2026-08-14 12:07 by HER12025
[硕博家园] 读博的好处 +4 lnee 2026-08-11 4/200 2026-08-14 10:20 by ahsoarli
[基金申请] filecode +15 documentary 2026-08-10 17/850 2026-08-14 10:08 by kissu88
[基金申请] 重要来源：本周末出结果 +10 瞬息宇宙 2026-08-12 10/500 2026-08-13 15:46 by likettle
[基金申请] 不应该看fileCode +7 且听虎啸 2026-08-12 9/450 2026-08-13 14:27 by flydreamws
[基金申请] Filecode 又变了，巨变 +3 WH3796 2026-08-12 4/200 2026-08-13 14:13 by 小木虫6752397
[基金申请] 分享一下我之前已中青C的计划书的filecode +4 布布和一二 2026-08-11 5/250 2026-08-13 12:56 by cratir
[基金申请] 结合人工智能，周易传统文化，filecode打分制来了，3分以上希望很大。 +3 Tide man 2026-08-12 4/200 2026-08-13 08:35 by ZJTJZ
[基金申请] 2019年青年基金涵评意见，大家看看几个A，几个B? +11 Tide man 2026-08-11 11/550 2026-08-13 07:35 by 撸猫猫
[基金申请] 帮忙看看fileCode +7 wwncly 2026-08-10 13/650 2026-08-11 19:36 by 冰心玉壶晴
[基金申请] 什么时候出结果，有咨询渠道？？？ +3 Tide man 2026-08-11 3/150 2026-08-11 17:54 by kudofaye
[基金申请] 据悉今年马上要出结果了 +7 瞬息宇宙 2026-08-10 8/400 2026-08-10 12:42 by Vivilian
[基金申请] 面上项目filecode邪修 +5 西山十月 2026-08-09 7/350 2026-08-10 07:32 by 仁砚薪传
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭