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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » IBRION = 5
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4010808

木虫 (小有名气)

[求助] IBRION = 5

请问IBRION=5的输出结果应如何解读，例如：
DYNMAT
  ------
      1   32    3
  12.011
     1    1  0.0500  0.0000  0.
*** *** ***
*** *** ***
论坛上说number of atom types (1) , number of atoms (of each type) (32), number of degrees of freedom (3)
atomic mass (es for each type)
#of the degree of freedom (1), #of the displacement (1) , displacement stepwidth (x,y,z) (POTIM 0.0 0.0)
那么对于后面的***的矩阵应如何理解？并且如何对角化得到频率。谢谢
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1楼 2011-08-21 10:59:56
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cenwanglai

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老和山猥琐派九段

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★ ★
youzhizhe(金币+2): 谢谢交流。 2011-08-24 10:38:40
引用回帖:
1楼: Originally posted by 4010808 at 2011-08-21 10:59:56:
请问IBRION=5的输出结果应如何解读，例如：
DYNMAT
  ------
      1   32    3
  12.011
     1    1  0.0500  0.0000  0.
*** *** ***
*** *** ***
论坛上说number of atom types (1) , number of  ...

结果中不是直接有频率吗？

用“1 f”所搜就看到了。

矩阵对角化，这个我不清楚如何从OUTCAR中抠出矩阵来用脚本对角化。可能是用对vtstool角化脚本直接处理OUTCAR或者EIGENVAL文件？查查脚本代码看看。
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2楼2011-08-21 15:45:41
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dxcharlary

专家顾问 (职业作家)
★
cenwanglai(金币+1): 谢谢参与讨论 2011-08-21 17:08:32
引用回帖:
2楼: Originally posted by cenwanglai at 2011-08-21 15:45:41:
结果中不是直接有频率吗？

用“1 f”所搜就看到了。

矩阵对角化，这个我不清楚如何从OUTCAR中抠出矩阵来用脚本对角化。可能是用对vtstool角化脚本直接处理OUTCAR或者EIGENVAL文件？查查脚本代码看看。

他这个不是OUTCAR里面的数据，是DYMAT文件里面的。不过不清楚为什么32个原子，只有3个自由度。
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3楼2011-08-21 17:04:54
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cenwanglai

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★
youzhizhe(金币+1): 谢谢交流。 2011-08-24 10:38:51
引用回帖:
3楼: Originally posted by dxcharlary at 2011-08-21 17:04:54:
他这个不是OUTCAR里面的数据，是DYMAT文件里面的。不过不清楚为什么32个原子，只有3个自由度。

做的是vtstool里面的dynamical matrix计算？

一般的IBRION = 5 计算没有 DYMAT文件输出呢。

[ Last edited by cenwanglai on 2011-8-21 at 17:07 ]
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4楼2011-08-21 17:06:22
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fengangelo

禁虫 (小有名气)
★ ★
youzhizhe(金币+2): 谢谢交流。 2011-08-24 10:38:58
4010808(金币+1): 2011-08-24 10:40:10
本帖内容被屏蔽
5楼2011-08-23 19:47:54
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cenwanglai

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youzhizhe(金币+2): 谢谢交流。 2011-08-24 15:54:17
引用回帖:
5楼: Originally posted by fengangelo at 2011-08-23 19:47:54:
我在IBRION=5算频率是为了找复数的频率（虚频）然后确定是不是过渡态。
我有4个原子设置为可以relax，其他的固定。会显示总共有12个degree of freedom
这样grep THz OUTCAR会得到12个频率

每个自由度对应一个频率。
4个原子，每个原子三个自由度，一共12个自由度。所以12个频率是正确的。
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6楼2011-08-24 12:33:35
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