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gzsoger

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[交流] 化学中的常用计算机软件与资源

化学中的常用计算机软件与资源

简单介绍如下,具体见附件

化学结构式
常见的这类软件有：ChemDraw, ChemWindow, ISIS Draw, ChemSketch等。三维结构
比较有名的化学三维结构显示与描绘软件有：Chem3D, WebLab Viewer Pro, RasWin, ChemBuilder 3D, ChemSite等，它们都能够以线图(wire frame), 球棍(ball and stick), CPK及丝带(ribbon)等模式显示化合物的三维结构。
数据处理
通用型的软件如：Origin, SigmaPlot等可以根据需要对实验数据进行数学处理、统计分析、付立叶变换、t-试验、线性及非线性拟合；绘制二维及三维图形如：散点图、条形图、折线图、饼图、面积图、曲面图、等高线图等。
文献管理
这类程序中有代表性的有：EndNote 4, Reference Manager和ProCite等图谱解析
核磁图谱的解析可以先利用ChemNMR, C13 Module for ChemWindow, gNMR等软件对目标化合物的化学位移进行估算或作出模拟谱，用以协助对该化合物图谱的指认。
IR Mentor Pro，及IR SearchMaster为专门用来辅助红外图谱解析的工具MassSpectra Simulator为质谱模拟程序
计算机辅助教学
这类的软件市面上非常多，不胜枚举。 CHAOS程序的出现比较早，ChemDraw的ultra版本包括了有机物的IUPAC命名功能，其中包括了一个Beilstein公司的AutoNom 2.0命名软件；AutoNom 4.0版，其功能更强大，除了给出IUPAC名称外，还给出CAS名称，更增加了对立体化学的支持。
量子化学计算
WinMOPAC为著名的半经验分子轨道(AM1, PM3, MINDO, MNDO/3等)计算程序MOPAC的商业版本, PC Spartan为WaveFunction公司的产品，分为标准版、Plus版及Pro版, HyperChem等功能比PC Spartan更强, Gamess为一免费的从头计算程序, Gaussian在量子化学界非常有名，,Jaguar为Schrodinger公司给使用工作站(如SGI, HP, DEC)及LINUX操作系统的PC所设计的从头计算及密度泛函计算程序,
Titan为设计PC Spartan的WaveFunction公司与设计Jaguar的Schrodinger公司合作的结晶,

[ Last edited by berlin on 2006-11-13 at 13:31 ]

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