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新虫 (小有名气)

[求助] 急!!!进化树构建时如何分析氨基酸序列??

急啊!!!各位朋友,在下最近克隆出来一些序列,想看一下这些序列进化关系如何,如果我要比较这些序列的核酸序列,是不是直接比较就行了?用不用先预测一下编码区再进行比对分析?如果我要比较氨基酸序列,是不是要先找出编码区?如果通过软件预测到有几个编码区(外显子)、有内含子的情况,那氨基酸序列是不是简单的把编码区的氨基酸拼接起来就行??请各位多多指教啊,多谢了!
愿做一颗小草,在山间吹吹风,晒晒太阳,等待日起日落,淡看世间百态。
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zhijiangli

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


wenjing120(金币+1): 积极应助!欢迎常来科研版!感谢您的交流! 2012-03-12 10:40:05
我建议你先把得到的序列比对一下,看看他们的保守性,如果保守性很高,序列之间差异不大,我觉得可以做一下进化树,另外,进一步分析他们为何保守,是编码序列还是其他的原因造成的;如果保守性不高,建议你翻译成氨基酸之后再进行比较,再做进化树。
缘分这东西O(∩_∩)O~
2楼2012-03-12 10:20:44
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