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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » discover 模块不能优化
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qiaobo

金虫 (小有名气)

[求助] discover 模块不能优化

我建立含有金属氧化物和聚合物的格子，想用discover 优化，总是报错。具体如下：Failed to add energy server contribution to the Job.
Failed to prepare structure for a forcefield based calculation.
The charging engine has failed to calculate a charge for 216 atoms.
There are 216 atoms which have not been typed.
这是为什么呢？该如何解决？
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1楼 2011-07-06 14:22:59
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fyy0210

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
zh1987hs(金币+2): 谢谢 2011-07-21 07:30:36
御剑江湖(金币+2): 谢谢 2011-07-21 14:08:26
qiaobo(金币+13): 说的对，已经改正，谢谢了 2011-08-31 08:33:00
2． 优化表面
要优化表面， 需要使用分子力学将其能量最小化。 尽管表面是离子型的， 但是 COMPASS
力场在对模型分配力场(typing)的时候需要 Al 原子和 O原子之间有键存在。然而，要对
体系进行正确计算，需要在分配好力场后将 Al-O 键删除。




这是在培训教程上看到的！
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6楼2011-07-20 23:17:27
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御剑江湖

荣誉版主 (著名写手)

天池冶海

优秀版主

【答案】应助回帖

qiaobo(金币+2): 2011-07-08 08:59:23
你的体系有216个原子，计算都没分配电荷，而且缺少力场吧
赞一下 回复此楼
莫问前尘事，只怜今世缘，承临纵横风，御剑凡尘路，蹉跎浮华，嬉笑洒脱。
2楼2011-07-06 18:18:02
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qiaobo

金虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by 御剑江湖 at 2011-07-06 18:18:02:
你的体系有216个原子，计算都没分配电荷，而且缺少力场吧

那该怎么解决呢
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3楼2011-07-07 09:07:13
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zyj8119

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★
御剑江湖(金币+1): 谢谢 2011-07-07 15:46:37
引用回帖:
Originally posted by qiaobo at 2011-07-07 09:07:13:
那该怎么解决呢

换力场，或者自己手动赋予力场。。。
赞一下(1人) 回复此楼
好好学习，天天向上。
4楼2011-07-07 09:52:48
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