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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » 其他 » 不知发这里合适不？求富勒烯C82的isomer
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chenweiguang

金虫 (小有名气)

[求助] 不知发这里合适不？求富勒烯C82的isomer

曾经求过，有好心人给我了9个Nanotube Molder导出的C82同分异构体，编号，对称性和文献中的9个也一样，但是我优化的时候总是不能收敛。
另外使用CaGe软件根据IPR原则也可以生成9种，不过编号，键长跟上面的9种不一样。
我也下载了CCDC，使用截止到2001年的数据库，没有搜到C82分子。
因此无奈前来求助，哪位朋友那里有更全的数据库能否帮忙看看有没有这9种，我想对比看看到底是怎么回事。
谢谢。
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1楼 2011-06-20 22:04:41
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bay__gulf

金虫 (著名写手)

刘苏州
★ ★
zhou2009(金币+2): 2011-06-21 10:42:22
不同软件的生成算法不同,编号不同的也没有关系.
原子间连接顺序这几个九种是一一对应的
键长键角也是各自软件内部根据一套简单的数学规则推算出来的
不是分子的真实构象
否则就不需要后面复杂的构象优化了
生成软件做到这一步就够了,至于不收敛, 那是道行问题
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4楼2011-06-21 10:07:35
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独唱团

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

chenweiguang(金币+50): 非常感谢 2011-06-21 09:51:07
9个，查收。。。d
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2楼2011-06-21 04:29:48
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chenweiguang

金虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by 独唱团 at 2011-06-21 04:29:48:
9个，查收。。。d

非常感谢！
请问你这些是从哪里得到的啊？
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3楼2011-06-21 09:50:47
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chenweiguang

金虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by bay__gulf at 2011-06-21 10:07:35:
不同软件的生成算法不同,编号不同的也没有关系.
原子间连接顺序这几个九种是一一对应的
键长键角也是各自软件内部根据一套简单的数学规则推算出来的
不是分子的真实构象
否则就不需要后面复杂的构象优化了
生 ...

谢谢，我也很奇怪。
其实就是一个简单的分子优化，放到一个盒子里，然后去跑（使用的VASP）。没有什么特别的设置，很纳闷，你有什么建议么？
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5楼2011-06-21 10:34:11
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