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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » 同个任务同样的节点数VASP4.6能算，而VASP5.2不能
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cavediger

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
youzhizhe(金币+5): 谢谢交流。 2011-06-16 09:50:48
youzhizhe(1ST强帖+1): 谢谢交流。 2011-06-16 09:51:16
zhang668(金币+3): 非常感谢详细指导 2011-06-16 15:00:22
引用回帖:
Originally posted by zhang668 at 2011-06-15 22:17:42:
对24个原子的体系的结构优化任务，256个节点，VASP4.6可以计算，但VASP5.2（自旋轨道耦合版本）计算得到段错误提示：
forrtl: severe (174): SIGSEGV, segmentation fault occurred。
用ulimit -a查了下stack s ...

1.查一查下OUTCAR里最后几行的提示，是否进入了主循环计算？
2.-heap-arrays  64 只是解决栈溢出问题，你只有那么点原子，考虑自旋也也不会产生此问题；
3.检查一下你的编译器的版本，INTEL 10.xxx编译器本身有bug，会遇到一下意想不到的问题；
4.FC=mpiifort，这个是自己该的还是自动生成的？一般MPI编译后，会建立个mpif90到ifort连接，即便并行编译，FC=mpif90 或 ifort都可以；
5.你在做测试吗？这么小的体系还用那么多个节点，并行效率很差，时间都浪费在CPU之间的通讯上了。你可以减少节点测试一下，或者串行试一下看看是否还有这个问题。
赞一下(2人) 回复此楼
我们都老得太快，却聪明得太迟。当我一路跌跌撞撞登上山巅，蓦然发现，本来就有一条笔直的路，直达山顶....
2楼2011-06-16 06:24:08
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