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lixiao85

银虫 (小有名气)

[求助] castep总是运算出错,哪位高手能帮忙解决一下呢??

Job started on host qyx-5636327b78b
at Wed Jul 30 21:45:17 2008

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|                                                 |
|      CCC   AA    SSS  TTTTT  EEEEE  PPPP        |
|     C     A  A  S       T    E      P   P       |
|     C     AAAA   SS     T    EEE    PPPP        |
|     C     A  A     S    T    E      P           |
|      CCC  A  A  SSS     T    EEEEE  P           |
|                                                 |
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|                                                 |
| Welcome to Materials Studio CASTEP version 5.0  |
| Ab Initio Total Energy Program                  |
|                                                 |
| Authors:                                        |
| M. Segall, M. Probert, C. Pickard, P. Hasnip,   |
| S. Clark, K. Refson, M. Payne                   |
|                                                 |
| Contributors:                                   |
| P. Lindan, P. Haynes, J. White, V. Milman,      |
| N. Govind, M. Gibson, P. Tulip, V. Cocula,      |
| B. Montanari, D. Quigley, M. Glover,            |
| L. Bernasconi, A. Perlov, M. Plummer,           |
| E. McNellis, J. Meyer                           |
|                                                 |
| Copyright (c) 2000 - 2009                       |
|                                                 |
| Please cite                                     |
|                                                 |
|     "First principles methods using CASTEP"     |
|                                                 |
|         Zeitschrift fuer Kristallographie       |
|           220(5-6) pp. 567-570 (2005)           |
|                                                 |
| S. J. Clark, M. D. Segall, C. J. Pickard,       |
| P. J. Hasnip, M. J. Probert, K. Refson,         |
| M. C. Payne                                     |
|                                                 |
|       in all publications arising from          |
|              your use of CASTEP                 |
|                                                 |
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This version was compiled for i686-windows-msvc2008 on Oct 22 2009

License checkout of MS_castep successful


Pseudo atomic calculation performed for O 2s2 2p4

Converged in 23 iterations to a total energy of -428.3332 eV


Pseudo atomic calculation performed for W 5s2 5p6 5d4 6s2

Converged in 28 iterations to a total energy of -1925.1153 eV

Calculation parallelised over    1 nodes.
K-points are distributed over    1 groups, each containing    1 nodes.

************************************ Title ************************************
CASTEP calculation from Materials Studio

***************************** General Parameters ******************************
  
output verbosity                               : normal  (1)
write checkpoint data to                       : WO31__0_0_2___2_.check
type of calculation                            : geometry optimization
stress calculation                             : off
density difference calculation                 : off
electron localisation func (ELF) calculation   : off
Hirshfeld analysis                             : off
unlimited duration calculation
timing information                             : on
memory usage estimate                          : on
write final potential to formatted file        : off
write final density to formatted file          : off
  
output         length unit                     : A
output           mass unit                     : amu
output           time unit                     : ps
output         charge unit                     : e
output         energy unit                     : eV
output          force unit                     : eV/A
output       velocity unit                     : A/ps
output       pressure unit                     : GPa
output     inv_length unit                     : 1/A
output      frequency unit                     : cm-1
output force constant unit                     : eV/A**2
output         volume unit                     : A**3
output   IR intensity unit                     : (D/A)**2/amu
output         dipole unit                     : D
output         efield unit                     : eV/A/e
  
wavefunctions paging                           : none
random number generator seed                   : randomised (214525484)
data distribution                              : optimal for this architecture
optimization strategy                          : balance speed and memory

*********************** Exchange-Correlation Parameters ***********************
  
using functional                               : Local Density Approximation
Divergence correction                          : off
DFT+D: Semi-empirical dispersion correction    : off

************************* Pseudopotential Parameters **************************
  
pseudopotential representation                 : reciprocal space
representation                      : reciprocal space

**************************** Basis Set Parameters *****************************
  
basis set accuracy                             : MEDIUM
plane wave basis set cut-off                   :   300.0000   eV
size of standard grid                          :     1.7500
largest prime factor in FFT                    :          5
finite basis set correction                    : none

**************************** Electronic Parameters ****************************
  
number of  electrons                           :  408.0   
net charge of system                           :  0.000   
net spin   of system                           :  0.000   
number of  up  spins                           :  204.0   
number of down spins                           :  204.0   
treating system as non-spin-polarized
number of bands                                :        204

********************* Electronic Minimization Parameters **********************
  
Method: Treating system as non-metallic,
         and number of  SD  steps               :          1
         and number of  CG  steps               :          4
  
total energy / atom convergence tol.           : 0.1000E-04   eV
eigen-energy convergence tolerance             : 0.1000E-05   eV
max force / atom convergence tol.              : ignored
convergence tolerance window                   :          3   cycles
max. number of SCF cycles                      :        100

************************** Density Mixing Parameters **************************
  
density-mixing scheme                          : Pulay
max. length of mixing history                  :         20
charge density mixing amplitude                : 0.5000   
charge density mixing g-vector                 :  1.500       1/A

********************** Geometry Optimization Parameters ***********************
  
optimization method                            : BFGS
variable cell method                           : fixed basis quality
max. number of steps                           :        100
estimated bulk modulus                         :  500.0       GPa
estimated                           :  1668.       cm-1
line minimiser tolerance                       :     0.4000
total energy convergence tolerance             : 0.5000E-04   eV/atom
        max ionic |force| tolerance             : 0.1000       eV/A
max ionic |displacement| tolerance             : 0.5000E-02   A
   max |stress component| tolerance             : 0.2000       GPa
convergence tolerance window                   :          2   steps
backup results every                           :          5   steps

*******************************************************************************
  

                           -------------------------------
                                      Unit Cell
                           -------------------------------
        Real Lattice(A)                      Reciprocal Lattice(1/A)
  30.2863636   0.0000000  -0.7380797        0.2073361   0.0000000  -0.0050528
   0.0000000  26.6865950   0.0000000        0.0000000   0.2354435   0.0000000
   0.1734615   0.0000000   7.1178178        0.0214996   0.0000000   0.8822165

                       Lattice parameters(A)       Cell Angles
                    a =   30.295356          alpha =   90.000000
                    b =   26.686595          beta  =   90.000000
                    c =    7.119931          gamma =   90.000000

                       Current cell volume = 5756.321084       A**3

                           -------------------------------
                                     Cell Contents
                           -------------------------------
                         Total number of ions in cell =   52
                      Total number of species in cell =    2
                        Max number of any one species =   40

            xxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxx
            x  Element    Atom        Fractional coordinates of atoms  x
            x            Number           u          v          w      x
            x----------------------------------------------------------x
            x  O            1         0.463795   0.447223   0.272200   x
            x  O            2         0.389255   0.388672   0.194720   x
            x  O            3         0.411544   0.388756   0.790070   x
            x  O            4         0.393001   0.443686   0.499161   x
            x  O            5         0.334486   0.447053   0.788008   x
            x  O            6         0.510012   0.392648   0.695559   x
            x  O            7         0.540787   0.392564   0.289231   x
            x  O            8         0.514173   0.459996   0.999625   x
            x  O            9         0.713795   0.447223   0.272200   x
            x  O           10         0.639255   0.388672   0.194720   x
            x  O           11         0.661544   0.388756   0.790070   x
            x  O           12         0.643001   0.443686   0.499161   x
            x  O           13         0.584486   0.447053   0.788008   x
            x  O           14         0.338993   0.478003   0.211992   x
            x  O           15         0.338927   0.590959   0.226961   x
            x  O           16         0.588993   0.478003   0.211992   x
            x  O           17         0.588927   0.590959   0.226961   x
            x  O           18         0.413467   0.532408   0.304441   x
            x  O           19         0.382692   0.532492   0.710769   x
            x  O           20         0.409306   0.465060   0.000375   x
            x  O           21         0.409721   0.587422   0.000000   x
            x  O           22         0.463729   0.621739   0.287169   x
            x  O           23         0.393416   0.608796   0.498786   x
            x  O           24         0.334552   0.621569   0.773039   x
            x  O           25         0.513758   0.625106   1.000000   x
            x  O           26         0.459750   0.590789   0.712831   x
            x  O           27         0.459684   0.477833   0.727800   x
            x  O           28         0.534224   0.536384   0.805280   x
            x  O           29         0.511935   0.536300   0.209930   x
            x  O           30         0.530063   0.603732   0.501214   x
            x  O           31         0.530478   0.481370   0.500839   x
            x  O           32         0.663467   0.532408   0.304441   x
            x  O           33         0.632692   0.532492   0.710769   x
            x  O           34         0.659306   0.465060   0.000375   x
            x  O           35         0.659721   0.587422   0.000000   x
            x  O           36         0.713729   0.621739   0.287169   x
            x  O           37         0.643416   0.608796   0.498786   x
            x  O           38         0.584552   0.621569   0.773039   x
            x  O           39         0.709750   0.590789   0.712831   x
            x  O           40         0.709684   0.477833   0.727800   x
            x  W            1         0.527715   0.453452   0.742351   x
            x  W            2         0.521387   0.453444   0.256662   x
            x  W            3         0.395764   0.471604   0.257649   x
            x  W            4         0.402092   0.471612   0.743338   x
            x  W            5         0.406958   0.615340   0.241512   x
            x  W            6         0.392144   0.615348   0.757501   x
            x  W            7         0.516521   0.597188   0.758488   x
            x  W            8         0.531335   0.597180   0.242499   x
            x  W            9         0.645764   0.471604   0.257649   x
            x  W           10         0.652092   0.471612   0.743338   x
            x  W           11         0.656958   0.615340   0.241512   x
            x  W           12         0.642144   0.615348   0.757501   x
            xxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxx


                         No user defined ionic velocities

                           -------------------------------
                                   Details of Species
                           -------------------------------

                               Mass of species in AMU
                                    O   15.9989996
                                    W  183.8500061

                          Electric Quadrupole Moment (Barn)
                                    O   -0.0255800 Isotope 17
                                    W    1.0000000 No Isotope Defined

                          Files used for pseudopotentials:
                                    O O_00.usp
                                    W W_00.usp

                           -------------------------------
                              k-Points For BZ Sampling
                           -------------------------------
                       MP grid size for SCF calculation is  1  1  5
                         Number of kpoints used =           3

             +++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++
             +  Number       Fractional coordinates        Weight  +
             +-----------------------------------------------------+
             +     1   0.000000   0.000000   0.400000   0.4000000  +
             +     2   0.000000   0.000000   0.200000   0.4000000  +
             +     3   0.000000   0.000000   0.000000   0.2000000  +
             +++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++

                           -------------------------------
                               Symmetry and Constraints
                           -------------------------------

         There are no symmetry operations specified or generated for this cell
         There are no ionic constraints specified or generated for this cell
                      Maximum deviation from symmetry =  0.00000         ANG
               Point group of crystal =     1: C1, 1, 1

                        Centre of mass is NOT constrained

                         Number of cell constraints= 6
                         Cell constraints are:  0 0 0 0 0 0

                         External pressure/stress (GPa)
                          0.00000   0.00000   0.00000
                                    0.00000   0.00000
                                              0.00000
  
+---------------- MEMORY AND SCRATCH DISK ESTIMATES PER NODE -----------------+
|                                                     Memory          Disk    |
| Model and support data                             1376.8 MB      1183.5 MB |
| Electronic energy minimisation requirements        1135.6 MB       635.0 MB |
|                                               ----------------------------- |
| Approx. total storage required per node            2512.5 MB      1818.5 MB |
|                                                                             |
| Requirements will fluctuate during execution and may exceed these estimates |
+-----------------------------------------------------------------------------+
------------------------------------------------------------------------ <-- SCF
SCF loop      Energy                           Energy gain       Timer   <-- SCF
                                               per atom          (sec)   <-- SCF
------------------------------------------------------------------------ <-- SCF
Initial  -3.38294986E+004                                        184.84  <-- SCF
      1  -3.88593196E+004                    9.67273276E+001    1141.41  <-- SCF
      2  -4.06443826E+004                    3.43281346E+001    1893.98  <-- SCF
      3  -4.07539480E+004                    2.10702661E+000    2671.84  <-- SCF
************************************************************************
   The memory required for this calculation exceeds machine capacity.

           Unable to continue. Run will be ABORTED.

    Suggestions:
      Check the run setup is reasonable; in particular cell dimensions,
      number of atoms, plane wave cutoff all affect memory consumption.

      Investigate the parameters "opt_strategy"/"opt_strategy_bias" and
      "page_wvfns" which may be used to reduce memory requirements.

      If the calculation is being run on a distributed memory computer
      consider increasing the number of processors.

      It may be necessary to run this calculation on another computer
      with more RAM or upgrade the physical RAM on the current system.
************************************************************************

Information for developers:
ALLOCATE request failed for array "wvfn_temp" in routine "nlpot_apply_nkns"
Current trace stack:
nlpot_apply_nkns
electronic_apply_H_recip_wv
electronic_apply_H_wv
electronic_minimisation
check_elec_ground_state
castep
尤其是最后九行什么意思啊???
我的计算机是4核8G内存的
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相信自己一定会成功!!
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lixiao85

银虫 (小有名气)

高手呢??恳求帮忙啊
相信自己一定会成功!!
2楼2011-05-31 08:22:21
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jqb040789

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


lixiao85(金币+5): 我曾经建立过一个比这个超晶胞还大的体系,运行了86步出问题了,我想可能是参数的问题,可是那次K点选取的是1*1*2,还是出现问题了,纠结啊 2011-05-31 09:19:54
franch(金币+1): 谢谢回帖交流 2011-05-31 09:33:43
The memory required for this calculation exceeds machine capacity.

           Unable to continue. Run will be ABORTED.

估计是内存不够,建议将K点取小些,或者建的超晶胞小些!虽然8G够多,但是估计还是内存的问题!希望对你有用!
3楼2011-05-31 09:08:53
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444239852

银虫 (正式写手)

我也遇到过这样的情况,我解决的办法是重新计算并看是否参数设置正确
希望能帮到你
4楼2011-05-31 09:35:19
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qiudong1009

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖


lixiao85(金币+5): 请问怎样扩展内存??我的程序在运行时,我的电脑显示内存使用大约在4G左右呢,期待您的回复 2011-05-31 11:15:52
zhang668(金币+1): 多谢交流 2011-05-31 16:18:38
貌似你只用了一个核计算,内存不够~~可以降低Ecut,或扩展内存,原来我也遇到过这个问题,扩展了内存就好了~
克己
5楼2011-05-31 10:22:21
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x163_yu

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖


lixiao85(金币+5): 哦??那您是怎么解决问题的??我们师姐的电脑内存比我的还小些呢,可是她的电脑就能跑起来啊,郁闷啊,纠结啊 2011-05-31 11:17:46
zhang668(金币+1): 多谢交流 2011-05-31 16:18:48
引用回帖:
Originally posted by lixiao85 at 2011-05-30 22:39:36:
Job started on host qyx-5636327b78b
at Wed Jul 30 21:45:17 2008

+-------------------------------------------------+
|                                                 |
|      CCC   AA     ...

我也遇到过类似的问题,内存不足是主要的原因,我听别人说要做超晶胞的计算至少要8个处理器,而且每个处理器应该分配2G内存,才能计算将近100多个原子的超晶胞
6楼2011-05-31 10:22:36
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lixiao85

银虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by 444239852 at 2011-05-31 09:35:19:
我也遇到过这样的情况,我解决的办法是重新计算并看是否参数设置正确
希望能帮到你

呵呵,谢谢你。我重新跑过了,我估计是参数设置的问题。以后多多交流啊
相信自己一定会成功!!
7楼2011-05-31 11:14:20
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gongcheng06

新虫 (初入文坛)

同样的问题  期待某高手答复
8楼2011-05-31 15:03:01
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lixiao85

银虫 (小有名气)

还有谁懂呢?恳请高手前来相助啊
相信自己一定会成功!!
9楼2011-06-01 19:02:08
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415999915

铁虫 (小有名气)

引用回帖:
516954楼: Originally posted by lixiao85 at 2011-05-30 22:39:36:
Job started on host qyx-5636327b78b
at Wed Jul 30 21:45:17 2008

+-------------------------------------------------+
|                                                 |
|      CCC   AA     ...

楼主问题解决了么?小弟也有这个内存不足的问题出现 你是怎么办的啊?请教!!
day day up!!!
10楼2012-03-16 21:46:23
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