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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » GenBank 提交序列，<200bp片段不予接收？
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billowzeng

金虫 (正式写手)
★ ★ ★
silicare(金币+3): 鼓励反馈交流 2011-05-27 11:51:52
引用回帖:
Originally posted by mirror3895 at 2011-05-24 08:12:41:
我实验室也有人出现过此类问题，但是后来发现是在提交时对序列描述错误，应该是可以提交的，建议再试试，注意要说明是16Sr DNA V3区DGGE切胶回收的片段（是DGGE的吧？）

还是不接收，我的留言是“The band1 to band12 were isolated from DGGE gel of 16S ribosomal V3  RNA gene, partial sequence. The sequences were about 180bp. This the reason the sequences were shorter than 200bp”
他的回复是“
However, this does not resolve the issue.
Some or all of the sequence(s) in your file(s) are less than 200 bp.
Unfortunately, we must inform you that we have a policy not to accept
sequences shorter than 200 bp. We realize that this has short-term
consequences for submitters, but feel that the long-term improvements
in the database will be helpful for all database users.
”
请问你们实验室同学是怎样提交的呢？
先谢谢了。
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11楼2011-05-25 10:05:03
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sunlblove

银虫 (小有名气)
多谢多谢
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12楼2011-05-25 23:24:26
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forrestgump

新虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
silicare(金币+2): 2011-05-27 11:52:22
NCBI上垃圾信息的确很多了，如果不是新异的基因序列建议不要再提交了，这样会影响访问速度的
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13楼2011-05-26 03:07:27
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billowzeng

金虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by forrestgump at 2011-05-26 03:07:27:
NCBI上垃圾信息的确很多了，如果不是新异的基因序列建议不要再提交了，这样会影响访问速度的

但是写文章的话，用到的序列必须要有基因序列号的。
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14楼2011-05-26 09:19:58
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zhaojin2399

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

引用回帖:
Originally posted by ezhaoheng at 2011-05-24 10:26:45:
惊现师姐~~

哎，成我们实验室开会了~~
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15楼2011-05-26 14:52:02
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mirror3895

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

billowzeng(金币+1): 2011-05-27 18:26:32
引用回帖:
Originally posted by billowzeng at 2011-05-25 10:05:03:
还是不接收，我的留言是“The band1 to band12 were isolated from DGGE gel of 16S ribosomal V3  RNA gene, partial sequence. The sequences were about 180bp. This the reason the sequences were shorte ...

我们是用sequin提交的，中间要填写很多资料，可能那个很重要吧
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16楼2011-05-26 20:07:43
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billowzeng

金虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by mirror3895 at 2011-05-26 20:07:43:
我们是用sequin提交的，中间要填写很多资料，可能那个很重要吧

我也是用sequin提交的，你们是最近时候提交的吗
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17楼2011-05-27 11:13:38
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zhangxianqin

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

billowzeng(金币+1): 2011-05-27 18:26:39
可以提交的！我的只有160多个都提交上去了！我是用sequin提交的！
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18楼2011-05-27 14:56:21
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billowzeng

金虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by zhangxianqin at 2011-05-27 14:56:21:
可以提交的！我的只有160多个都提交上去了！我是用sequin提交的！

有哪些要注意的地方吗？
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19楼2011-05-27 18:27:21
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mirror3895

铁杆木虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by zhaojin2399 at 2011-05-26 14:52:02:
哎，成我们实验室开会了~~

那你还来凑热闹
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20楼2011-05-27 19:30:27
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