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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » 其他 » 关于两个蛋白质结构叠合的原理（或者相关的程序）
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O123yh

铜虫 (初入文坛)
我现在也在弄RMSD算法程序，寻找用C写的程序，目前算法已经找到，是Kalbsch algorithm,,自己找一下，这个算法就是算RMSD的，
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11楼2015-12-17 16:43:01
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O123yh

铜虫 (初入文坛)
引用回帖:
6楼: Originally posted by zpliu09 at 2011-06-28 22:33:13
谢谢你一直的关注阿！
如何使用软件算出RMSD这方面我还是有一点了解。我现在做的蛋白质结构预测，需要自己编程对蛋白数据进行叠合处理。所以没法直接用像你说的这类软件。
我是希望最好能找到源代码（最好是C编的 ...

我也是需要自己编程对蛋白数据进行叠合处理，正在寻找有没有这方面的C程序
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12楼2015-12-17 16:47:40
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许你安然然

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
5楼: Originally posted by cedarice at 2011-06-26 22:27:18
这个有相应的软件可以实现，如chimera，但是不清楚能否指定相应位置进行alignment。另外可以在参考Wiki上的这个介绍：http://en.wikipedia.org/wiki/Structural_alignment

请问您知道什么软件可以实现指定残基的alignment嘛？

发自小木虫Android客户端
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13楼2017-05-23 19:33:41
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