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dx357

铜虫 (初入文坛)

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[求助] 如何确定反应中间体

在做过渡态计算中找到一个过渡态，有一个虚频。做irc时能跑到产物，跑向反应物那边接近反应物，取出边上的结构放开优化之后的是不是就是中间体？谢谢

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tiandaochouqin...war craft

1楼 2011-05-05 16:17:18

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kaegi

金虫 (小有名气)

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【答案】应助回帖

引用回帖:

Originally posted by dx357 at 2011-05-05 16:17:18:
在做过渡态计算中找到一个过渡态，有一个虚频。做irc时能跑到产物，跑向反应物那边接近反应物，取出边上的结构放开优化之后的是不是就是中间体？谢谢

这样子得到的反应物可以认为是活性中间体，因为他直接与你的过渡态相连。但是这样子找到的中间体（包括生成物）却不一定是最稳定的中间体。他们可能还会通过异构化，变为更为稳定形式，这些“更稳定”的中间体才是你需要的中间体，当然在做反应坐标的时候一般你也可以把活性中间体放入其中，使得反应坐标更加完整。至于到底哪一种中间体才更稳定，需要楼主查阅文献，晶体数据库，结合自己的化学知识去判断以及计算验证。