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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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Gina88

木虫 (正式写手)

[求助] 写了一个fortran90的小程序，编译通不过，请大侠帮忙

program cell-POSCAR

!announcement begin***********************************
implicit none
real(8)::cellcon(3,3)       !lattice constance
real(8),allocatable::atomcoor(:,  !direct coordinate of atoms
integer,allocatable::type(
integer i,j,k,m,n           !m:atom number,n:type number
character(len=1) nonsense    !to contain something that will not be used
character(len=2) position   !to read %
character(len=2) element1,element2  
!End announcement************************************

!Begin reading data from "cell"****************************
open(unit=18,file="cell",status="old"
read(18,*)nonsense
do i=1,3  
  read(18,*)cellcon(i,1),cellcon(i,2),cellcon(i,3)
end do
read(18,*)position
read(18,*)nonsense
read(18,*)nonsense
n=0;m=0
read(18,*)element2
do while(position/=element2)
  n=n+1
  element1=element2
  do while(element1==element2)
    m=m+1
    read(18,*)element2
  end do
end do
close(18)

allocate(type(n))
allocate(atomcoor(m,3))

open(unit=28,file="cell",status="old"
read(28,*)nonsense
read(28,*)nonsense
read(28,*)nonsense
read(28,*)nonsense
read(28,*)nonsense
read(28,*)nonsense
read(28,*)nonsense
read(28,*)element2,atomcoor(1,1),atomcoor(1,2),atomcoor(1,3)
i=1;k=1
element1=element2
if (m==1) then
  type(1)=1
else if
  do j=2,m
    read(28,*)element2,atomcoor(j,1),atomcoor(j,2),atomcoor(j,3)
    if(element1==element2) then
      k=k+1
      if(m==j) type(i)=k
    else if
      type(i)=k
      i=i+1
      element1=element2
      k=1
      if(m==j) type(i)=k
    end if   
  end do
end if
close(28)
!End reading data from "cell"****************************

!Begin writing to "POSCAR"******************************
open(unit=38,file="POSCAR",status="replace"
write(38,10)System
write(38,100)cellcon(1,1)
do i=1,3
  write(38,200)(cellcon(i,j)/cellcon(1,1),j=1,3)
end do
write(38,60)(type(i),i=1,n)
write(38,20)Selective,dynamic
write(38,30)Direct
do i=1,m
  write(38,300)(atomcoor(i,j),j=1,3)
end do
10 FORMAT(1X,A6)
20 FORMAT(1X,A9,1X,A7)
30 FORMAT(1X,A6)
60 FORMAT(1X,n(I3,2X))
100 FORMAT(1X,F18.16)
200 FORMAT(1X,3(F18.16,3X))
300 FORMAT(1X,F18.16,2X,F18.16,2X,F18.16,2X,'T',2X,'T',2X,'T')
close(38)
!End writing to "POSCAR"********************************

end
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1楼 2011-05-04 17:51:43
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snoopyzhao

至尊木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
余泽成(金币+3): 辛苦了！ 2011-05-19 19:21:37
引用回帖:
Originally posted by Gina88 at 2011-05-08 17:54:09:
附件是我上传的CHGCAR，您可以将它复制一下，一份命名为CHGCAR1，另一份命名为CHGCAR2

你还是没有给全，呵呵，不过不要紧，你的问题在于element不能那么读, read(12,*) 这种只对数字有用，所以，关于字符串，只能人工解析。

下面是一个实现，我没有在你的那个程序上改，你自己看看能不能理解……
CODE:
program test
implicit none
integer :: i, k
integer :: line_len ! length of element line without leading and tailing space.
integer :: atomsum
character(len=80) :: line
character(len=2), dimension(:), allocatable :: element
integer, dimension(:), allocatable :: atomnum

open(unit=12, file = 'CHGCAR')

do i=1,5
read(12,*)
end do

read(12,'(a)') line
line = adjustl(line)
line_len = len_trim(line)

atomsum=1
do i=1,line_len
   if(line(i:i) == ' ' .and. line(i:i+1) /= ' ') atomsum=atomsum+1
end do

write(*,*) atomsum

allocate(element(atomsum))
allocate(atomnum(atomsum))

k = 1
do i=1,line_len
   if(line(i:i) /= ' ' .and. line(i:i+1) == ' ') then
       element(k) = line(i:i)
       k = k + 1
    end if
   if(line(i:i) /= ' ' .and. line(i:i+1) /= ' ') then
       element(k) = line(i:i+1)
       line(i+1:i+1) = ' '
       k = k + 1
    end if
end do


read(12, *) (atomnum(i), i=1,atomsum)

write(*, *) (atomnum(i), i=1,atomsum)
write(*, '(a5)') (element(i), i=1,atomsum)

end program test
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34楼2011-05-08 19:31:46
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Gina88

木虫 (正式写手)
这个是cell的内容
%BLOCK LATTICE_CART
      12.782529349912258      -0.000000000000028       0.000000000000001
      -0.000000000000000      13.529995000000000       0.000000000000001
       0.000000000000000       0.000000000000000      10.000000000000000
%ENDBLOCK LATTICE_CART

%BLOCK POSITIONS_FRAC
  H   0.0555000007152556   0.1666999995708470   0.5000000000000000
  H   0.2221666673819220   0.0666999995708464   0.5000000000000000
  H   0.1110555562708110   0.0666999995708466   0.5000000000000000
  H   0.1110555562708110   0.0666999995708466   0.5000000000000000
  C   0.2777222229374780   0.1666999995708470   0.5000000000000000
  C   0.3888333340485890   0.1666999995708470   0.5000000000000000
  C   0.5555000007152560   0.0666999995708465   0.5000000000000000
  S   0.4443888896041450   0.0666999995708466   0.5000000000000000
  S   0.6110555562708110   0.1666999995708470   0.5000000000000000
  si   0.6110555562708110   0.1666999995708470   0.5000000000000000
%ENDBLOCK POSITIONS_FRAC
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2楼2011-05-04 17:52:59
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Gina88

木虫 (正式写手)
那个笑脸：）是
冒号+右括号

那个红脸”）是
右括号
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3楼2011-05-04 17:56:30
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Gina88

木虫 (正式写手)
program cell-POSCAR

!announcement begin***********************************
implicit none
real(8)::cellcon(3,3)       !lattice constance
real(8),allocatable::atomcoor(:,  !direct coordinate of atoms
integer,allocatable::type(
integer i,j,k,m,n           !m:atom number,n:type number
character(len=1) nonsense    !to contain something that will not be used
character(len=2) position   !to read %
character(len=2) element1,element2  
!End announcement************************************

!Begin reading data from "cell"****************************
open(unit=18,file="cell",status="old"
read(18,*)nonsense
do i=1,3  
  read(18,*)cellcon(i,1),cellcon(i,2),cellcon(i,3)
end do
read(18,*)position
read(18,*)nonsense
read(18,*)nonsense
n=0;m=0
read(18,*)element2
do while(position/=element2)
  n=n+1
  element1=element2
  do while(element1==element2)
    m=m+1
    read(18,*)element2
  end do
end do
close(18)

allocate(type(n))
allocate(atomcoor(m,3))

open(unit=28,file="cell",status="old"
read(28,*)nonsense
read(28,*)nonsense
read(28,*)nonsense
read(28,*)nonsense
read(28,*)nonsense
read(28,*)nonsense
read(28,*)nonsense
read(28,*)element2,atomcoor(1,1),atomcoor(1,2),atomcoor(1,3)
i=1;k=1
element1=element2
if (m==1) then
  type(1)=1
else if
  do j=2,m
    read(28,*)element2,atomcoor(j,1),atomcoor(j,2),atomcoor(j,3)
    if(element1==element2) then
      k=k+1
      if(m==j) type(i)=k
    else if
      type(i)=k
      i=i+1
      element1=element2
      k=1
      if(m==j) type(i)=k
    end if   
  end do
end if
close(28)
!End reading data from "cell"****************************

!Begin writing to "POSCAR"******************************
open(unit=38,file="POSCAR",status="replace"
write(38,10)System
write(38,100)cellcon(1,1)
do i=1,3
  write(38,200)(cellcon(i,j)/cellcon(1,1),j=1,3)
end do
write(38,60)(type(i),i=1,n)
write(38,20)Selective,dynamic
write(38,30)Direct
do i=1,m
  write(38,300)(atomcoor(i,j),j=1,3)
end do
10 FORMAT(1X,A6)
20 FORMAT(1X,A9,1X,A7)
30 FORMAT(1X,A6)
60 FORMAT(1X,n(I3,2X))
100 FORMAT(1X,F18.16)
200 FORMAT(1X,3(F18.16,3X))
300 FORMAT(1X,F18.16,2X,F18.16,2X,F18.16,2X,'T',2X,'T',2X,'T')
close(38)
!End writing to "POSCAR"********************************

end
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4楼2011-05-04 17:58:28
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