24小时热门版块排行榜    

查看: 1155  |  回复: 7
本帖产生 1 个 模拟EPI ,点击这里进行查看
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

zxm86

金虫 (初入文坛)

[求助] 扩散

在计算某一环状物质的均方位移图时,我发现它的总均方位移图为一条S型曲线,按照常理来说,均方位移图用该是直线啊,急需求助于各位高人!另外,它在X、Y、Z三个方向上运动还受限,这又是怎么回事啊?求助于各位!急······
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ChemiAndy

木虫 (正式写手)


★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
ghcacj(金币+8): 谢谢 2011-07-04 12:54:48
明白了,你说的就是向一个方向的平动。原因是我前面说的,模拟之前,软件会根据预设温度T计算总动能3/2*kT,再按照Boltzmann分布给每个原子随机分配初始速度vi,使得sum(1/2*m*vi^2)-3/2*kT。这种随机分配很可能造成整个分子的合速度在某个方向上不为0,导致分子整体向那个方向移动,除非它受到碰撞,否则不会改变方向。

你的分子的单向扩散是因为你的体系里或者没有其它分子,或者有溶剂比如水分子,但是因为水分子相比你的环状很小,碰撞对该大分子动能的耗散影响很小,其平动方向的改变会极其缓慢。所以这不是“运动受限”。而是由于体系所包含的环状分子个数少(1个)而引起的非物理的效应。你多加几个分子应该就不会这样了。

其实不只有平动,还会有转动。振动,转动, 平动(扩散)是分子运动的三个基本形式。
6楼2011-07-04 01:13:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 8 个回答

ChemiAndy

木虫 (正式写手)


【答案】应助回帖

★ ★ ★
zh1987hs(金币+3): 谢谢 2011-07-01 19:45:07
zxm86(金币+10): 谢谢啊 2011-07-03 09:36:25
1. 使用周期性的盒子模拟,均方位移的确是S形曲线。。。因为从那边出等于这边进阿伙计。

2. 按常理是没有这么小的盒子的,一直扩散的话,当然是直线。呵呵
2楼2011-07-01 12:12:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zxm86

金虫 (初入文坛)

引用回帖:
Originally posted by ChemiAndy at 2011-07-01 12:12:20:
1. 使用周期性的盒子模拟,均方位移的确是S形曲线。。。因为从那边出等于这边进阿伙计。

2. 按常理是没有这么小的盒子的,一直扩散的话,当然是直线。呵呵

首先谢谢你帮我解决困扰已久的问题!另外我还想问一下,这个环状物质在X/Y/X三方运动中某一方向受限,这是怎么回事啊?如果从结构角度来解释,也只能是环状结构舒服了它的扩散。那用分子间作用力可以解释嘛?或者从其他什么角度可以解释?
  谢谢,期待回复!
3楼2011-07-03 09:59:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ChemiAndy

木虫 (正式写手)



ghcacj(金币+1): 谢谢 2011-07-04 12:53:57
"这个环状物质在X/Y/X三方运动中某一方向受限",不明白你指的是什么。是不是这个分子一直整体向某个方向移动?如果是这样的话,是因为生成初始速度的时候在某个方向上的净速度不为0导致的。

“环状结构舒服了它的扩散”,环状结构本身与分子的整体平动并不矛盾啊。还是我没理解你的问题?
4楼2011-07-03 12:26:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 关于Filecode分析方法 +9 majunge000 2026-08-10 12/600 2026-08-13 23:20 by iwuli
[文学芳草园] 阿姨 +4 汪汪锅 2026-08-09 4/200 2026-08-13 19:43 by arzu_hma
[基金申请] FileCode能看出啥? +10 要乐观耀哥 2026-08-10 28/1400 2026-08-13 17:51 by 医学老男孩
[基金申请] 重要来源:本周末出结果 +10 瞬息宇宙 2026-08-12 10/500 2026-08-13 15:46 by likettle
[基金申请] 不应该看fileCode +7 且听虎啸 2026-08-12 9/450 2026-08-13 14:27 by flydreamws
[基金申请] Filecode 又变了,巨变 +3 WH3796 2026-08-12 4/200 2026-08-13 14:13 by 小木虫6752397
[基金申请] 分享一下我之前已中青C的计划书的filecode +4 布布和一二 2026-08-11 5/250 2026-08-13 12:56 by cratir
[基金申请] 我的国基提前知道中了,可是同事的操作让我实在接受不了,怎么会有这样的人 +9 家与远方 2026-08-10 14/700 2026-08-13 09:41 by 臭臭不臭01
[基金申请] 结合人工智能,周易传统文化,filecode打分制来了,3分以上希望很大。 +3 Tide man 2026-08-12 4/200 2026-08-13 08:35 by ZJTJZ
[基金申请] 帮忙看看fileCode +7 wwncly 2026-08-10 13/650 2026-08-11 19:36 by 冰心玉壶晴
[硕博家园] 读博的好处 +3 lnee 2026-08-11 3/150 2026-08-11 18:10 by 希望我好好的
[基金申请] 什么时候出结果,有咨询渠道??? +3 Tide man 2026-08-11 3/150 2026-08-11 17:54 by kudofaye
[基金申请] 关于代码变化问题,想知道的进来 +17 且听虎啸 2026-08-07 24/1200 2026-08-10 18:35 by zhangduo2008
[基金申请] 国自然结果 +4 Vierhys 2026-08-10 8/400 2026-08-10 15:06 by Vierhys
[基金申请] 据悉今年马上要出结果了 +7 瞬息宇宙 2026-08-10 8/400 2026-08-10 12:42 by Vivilian
[基金申请] 2026国自然放榜时间 +9 布布和一二 2026-08-08 9/450 2026-08-10 11:22 by xxxx2020
[基金申请] 关于filecode,很负责任的告诉大家 +6 爱看书的可乐 2026-08-08 7/350 2026-08-08 22:13 by a_niu
[基金申请] 关于filecode +4 布布和一二 2026-08-07 7/350 2026-08-07 22:55 by zhanghaozhu
[基金申请] 化学口download_prp&fileCode的固定段好像这几天一直没变,有变的大神么? +3 Tide man 2026-08-07 4/200 2026-08-07 22:39 by Tide man
[基金申请] filecode变化情况 +6 布布和一二 2026-08-07 22/1100 2026-08-07 14:45 by 且听虎啸
信息提示
请填处理意见