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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » 如何做出displacement与时间的图？
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咖啡喝不醉

新虫 (初入文坛)

[求助] 如何做出displacement与时间的图？

在做扩散系数时，看到文献中有纵坐标为displacement，横坐标为时间的图，这样的图可用来描述分子的实际的运动状态。请问这样的图如何做出呢？急盼回复！
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1楼2011-04-27 09:08:11
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zyj8119

木虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by 咖啡喝不醉 at 2011-04-27 09:08:11:
在做扩散系数时，看到文献中有纵坐标为displacement，横坐标为时间的图，这样的图可用来描述分子的实际的运动状态。请问这样的图如何做出呢？急盼回复！

不明白你的意思，给个图看看？
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好好学习，天天向上。
2楼2011-04-27 10:37:03
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咖啡喝不醉

新虫 (初入文坛)
★
御剑江湖(金币+1): 鼓励 2011-04-28 08:22:28
就是这样的图
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3楼2011-04-27 20:54:11
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zyj8119

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
御剑江湖(金币+2): 谢谢 2011-04-28 08:23:02
咖啡喝不醉(金币+1): 2011-04-28 08:52:08
引用回帖:
Originally posted by 咖啡喝不醉 at 2011-04-27 20:54:11:
就是这样的图

貌似MS里面只能给出MSD对于时间的曲线吧？
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好好学习，天天向上。
4楼2011-04-27 21:54:50
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咖啡喝不醉

新虫 (初入文坛)
对的，但是我需要的是这个样子的一个图。听说是需要编程序，可是我编了好久也没有编出来。不过做这个的人好像也不少了。不知您对编程这方面了解吗？可以指导我一下吗？
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5楼2011-04-28 08:51:53
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zyj8119

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
咖啡喝不醉(金币+4): 2011-04-29 16:23:27
御剑江湖(金币+2): 谢谢 2011-04-29 19:10:00
引用回帖:
Originally posted by 咖啡喝不醉 at 2011-04-28 08:51:53:
对的，但是我需要的是这个样子的一个图。听说是需要编程序，可是我编了好久也没有编出来。不过做这个的人好像也不少了。不知您对编程这方面了解吗？可以指导我一下吗？

你得首先找到算法，比如说是MSD的后一个Y减去前一个Y，然后与时间的关系，这样就只剩下用程序语言操作文件了。
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好好学习，天天向上。
6楼2011-04-28 10:17:01
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ti_pn

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
御剑江湖(金币+3): 谢谢 2011-05-04 21:39:05
其实应当是MSD即均方根位移。用MS可以分析直接计算出来，不过分析之前应当对你所关心的分子定义为一个set，然后再做MSD分析。
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7楼2011-05-04 15:25:57
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ti_pn

金虫 (正式写手)
不好意思，看错题了。
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8楼2011-05-04 15:27:46
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