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银虫 (小有名气)

[交流] 求解：REMD（replica exchange molecular dynamics）

最近看文献时，看到一个测蛋白质结构的REMD（replica exchange molecular dynamics）法，看解释也看的云里雾里的，那位高手知道这个REMD是神马意思啊？

1楼 2011-04-25 19:56:31

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银虫 (小有名气)

求帮助啊...

2楼2011-04-28 12:36:37

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银虫 (小有名气)

那位高人指点，指点吧...

3楼2011-04-29 13:08:48

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新虫 (小有名气)

★
hwandy87(金币+1):谢谢参与

给你这个文章看看，http://ambermd.org/tutorials/adv ... _chem_phys_lett.pdf
是这个REMD计算法发明者的论文，我最近也刚开始学习这个，看的也是头晕。
希望高人能简明的解释一下。
用amber的计算流程请参考amber官网教程：http://ambermd.org/tutorials/advanced/tutorial7/

4楼2011-08-19 09:42:51

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qqaoqq5楼

2011-08-29 17:32 回复

hwandy87(金币+1):谢谢参与