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天使托专家顾问 (职业作家)
T.Shen
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iPad在手，轻松查看蛋白结构 已有1人参与
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随着科学家逐渐解析出更多蛋白的结构，并将这些结构添加到数据库中，目前的蛋白结构数正在快速增长。过去，如果想要查看某个蛋白的结构，研究人员首先需要下载这个蛋白的结构数据组，然后将文件导入特殊的软件程序中。这个过程可不简单呢。 幸好，一些蛋白方面的应用程序被开发出来，让人们可以更轻松、更方便地随时随地查看蛋白质的结构。 iProtein 尽管乍一看，iProtein的主页平淡无奇，但是这只是假象，那些搞蛋白的肯定会被其内容所吸引。在其主页上有5块可点击的内容：序列、结构、家族、位点和结合配体。在序列和结构选项中，您可以输入一个关键词或PDB代码，页面上将会列出与之匹配的所有蛋白，以氨基酸或结构形式。在序列模式下，点击可下载的序列将启动序列搜索，来寻找相似的序列。在结构模式下，将会出现蛋白名称、分类、来源、参考文献和结构等。在家族选项中，您将了解到不同蛋白家族的成员。 结合配体这个选项可能会对药物学家有用。您可以在上面构建自己的分子，并提交，用于分析潜在的蛋白相互作用。如果您的配体能与蛋白结合，那么程序将会列出这一系列蛋白，以及PDB信息和配体结合的位点。如需查看配体以及蛋白的结构，iProtein将会链接到另一个iPad应用程序Molecules，我们下面将会介绍。 iProtein这款程序是由Eidogen-Sertanty, Inc.为iPad开发的，需要4.99美元，当然，有5天的免费试用，喜欢再买呗。 Molecules 这款程序是由Sunset Lake Software开发的，主要是用来查看蛋白质的三维结构。结构可向不同方向旋转，并随心所欲移动，通过手指滑动，还可轻松放大。速度快得惊人，某一特定氨基酸的放大和缩小似乎只是一瞬间。它还有一个功能，就是鉴定特定结构中关键的氨基酸残基，或只关注蛋白的某一部分。顺便提一句，它是免费的。 |
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