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kwit

金虫 (初入文坛)

[求助] cube结果文件如何限定结果范围

请帮忙看下:
现在有p1.com到p20.com，20个文件。用g03命令处理后，得到20个cube静电势文件。
发现每个cube文件的值都在不同区间，请问如何添加参数设置，把计算结果值统一限定在某个范围内（如-5到0）？

下面是p1.com输入文件：

#am1 cube=(cards,potential) test nosymm

title card

0  2
N     18.76800     -10.63500     -11.14500
H     18.08800     -10.03300     -10.72700
H     18.68600     -11.55700     -10.76700
H     18.63700     -10.66000     -12.13600
C     20.11700     -10.11300     -10.85100
H     20.16100     -9.13400     -11.31200
C     20.31500     -9.82400     -9.35200
H     21.38300     -9.53100     -9.21700
H     19.70900     -8.93600     -9.06400
C     20.01900     -10.98000     -8.40100
H     19.94900     -10.61200     -7.35600
H     19.04000     -11.43800     -8.66300
S     21.27200     -12.31800     -8.40200
C     20.44000     -13.49400     -7.35200
H     21.05800     -14.40700     -7.21100
H     20.23800     -13.06000     -6.34900
H     19.46800     -13.80500     -7.79200
C     21.26400     -10.96200     -11.44800
O     22.22800     -10.41100     -11.99000
C     22.22100     -12.92900     -13.63300
O     21.78000     -12.06900     -13.89200
O     22.82000     -13.64600     -13.98900
N     20.95700     -12.24000     -11.59000
H     20.06700     -12.57600     -11.28700
C     21.84700     -13.26500     -12.18200
H     22.76200     -13.25800     -11.60200
C     21.23100     -14.66800     -11.99800
H     21.95400     -15.40200     -12.42300
H     21.16000     -14.89300     -10.91000
C     19.87100     -14.90000     -12.66300
H     19.24800     -15.54600     -12.00300
H     19.34500     -13.92300     -12.76300
C     20.04200     -15.57300     -14.02900
H     20.77800     -14.98400     -14.62200
H     20.48000     -16.58500     -13.86500
C     18.72000     -15.69100     -14.78700
H     18.83500     -16.36000     -15.66900
H     17.92800     -16.11000     -14.12800
N     18.27600     -14.37300     -15.26300
H     17.37700     -14.46500     -15.77800
H     18.14500     -13.73600     -14.45100
H     18.99700     -13.97400     -15.89700

p1.cube
-1  -30.000000  -24.000000  -30.000000
128   0.529177    0.000000    0.000000
128   0.000000    0.529177    0.000000
128   0.000000    0.000000    0.529177
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1楼2011-04-20 20:54:16
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yyallen2003

木虫 (知名作家)
请问，这个是哪个方面的啊？
我怎么看不懂。
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人的生命是有限的， 但追求思想自由和学术独立的精神将永存。
2楼2011-04-20 21:19:51
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奔鲨

铁虫 (著名写手)
计算结果是在某种方法下 的结果，如果结果和你的想象不一样，可以分析，是否方法的影响，是否精度的问题，是否溶剂的影响，等等。
赞一下 回复此楼
to realize something, never complain too much about the effort, you have no right to say you don't like.
3楼2011-04-21 16:11:59
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zhou2009

版主 (著名写手)

【答案】应助回帖

kwit(金币+2): 2011-04-25 20:19:59
你希望“把计算结果值统一限定在某个范围内（如-5到0）”是什么意思？

你求potential，它的值有正有负，有大有小，为什么要限定？

如果你只想考察、比较-5到0的potential的值，这通常仅只是分子的电荷集居部位（负离子）或孤对电子的部位，作图时可将等值线的取值选择为-5到0即可，如在sigmaplot中作图时，这时此外的正值将不会出现在图中。-5以外还有大量的负值，将也不会表达出来。负值表明此处电子蓬松，易于给出电子。

如果你只想考察、比较-5到0的这个空间的potential值，那么你在计算cube时，将起始点定在-5，终点定在0即可，（你现在起始点是 -30.000000  -24.000000  -30.000000 ），终点定在0是由调整格点数和步长来决定的。
你的分子如此之大，真想只看-5到0这个空间的么？
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4楼2011-04-22 10:41:16
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