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cube结果文件如何限定结果范围
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请帮忙看下: 现在有p1.com到p20.com，20个文件。用g03命令处理后，得到20个cube静电势文件。 发现每个cube文件的值都在不同区间，请问如何添加参数设置，把计算结果值统一限定在某个范围内（如-5到0）？ 下面是p1.com输入文件： #am1 cube=(cards,potential) test nosymm title card 0 2 N 18.76800 -10.63500 -11.14500 H 18.08800 -10.03300 -10.72700 H 18.68600 -11.55700 -10.76700 H 18.63700 -10.66000 -12.13600 C 20.11700 -10.11300 -10.85100 H 20.16100 -9.13400 -11.31200 C 20.31500 -9.82400 -9.35200 H 21.38300 -9.53100 -9.21700 H 19.70900 -8.93600 -9.06400 C 20.01900 -10.98000 -8.40100 H 19.94900 -10.61200 -7.35600 H 19.04000 -11.43800 -8.66300 S 21.27200 -12.31800 -8.40200 C 20.44000 -13.49400 -7.35200 H 21.05800 -14.40700 -7.21100 H 20.23800 -13.06000 -6.34900 H 19.46800 -13.80500 -7.79200 C 21.26400 -10.96200 -11.44800 O 22.22800 -10.41100 -11.99000 C 22.22100 -12.92900 -13.63300 O 21.78000 -12.06900 -13.89200 O 22.82000 -13.64600 -13.98900 N 20.95700 -12.24000 -11.59000 H 20.06700 -12.57600 -11.28700 C 21.84700 -13.26500 -12.18200 H 22.76200 -13.25800 -11.60200 C 21.23100 -14.66800 -11.99800 H 21.95400 -15.40200 -12.42300 H 21.16000 -14.89300 -10.91000 C 19.87100 -14.90000 -12.66300 H 19.24800 -15.54600 -12.00300 H 19.34500 -13.92300 -12.76300 C 20.04200 -15.57300 -14.02900 H 20.77800 -14.98400 -14.62200 H 20.48000 -16.58500 -13.86500 C 18.72000 -15.69100 -14.78700 H 18.83500 -16.36000 -15.66900 H 17.92800 -16.11000 -14.12800 N 18.27600 -14.37300 -15.26300 H 17.37700 -14.46500 -15.77800 H 18.14500 -13.73600 -14.45100 H 18.99700 -13.97400 -15.89700 p1.cube -1 -30.000000 -24.000000 -30.000000 128 0.529177 0.000000 0.000000 128 0.000000 0.529177 0.000000 128 0.000000 0.000000 0.529177 |
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- 性别: GG
- 专业: 理论和计算化学
- 管辖: 量子化学
【答案】应助回帖
kwit(金币+2): 2011-04-25 20:19:59
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你希望“把计算结果值统一限定在某个范围内（如-5到0）”是什么意思？ 你求potential，它的值有正有负，有大有小，为什么要限定？ 如果你只想考察、比较-5到0的potential的值，这通常仅只是分子的电荷集居部位（负离子）或孤对电子的部位，作图时可将等值线的取值选择为-5到0即可，如在sigmaplot中作图时，这时此外的正值将不会出现在图中。-5以外还有大量的负值，将也不会表达出来。负值表明此处电子蓬松，易于给出电子。 如果你只想考察、比较-5到0的这个空间的potential值，那么你在计算cube时，将起始点定在-5，终点定在0即可，（你现在起始点是 -30.000000 -24.000000 -30.000000 ），终点定在0是由调整格点数和步长来决定的。 你的分子如此之大，真想只看-5到0这个空间的么？ |
4楼2011-04-22 10:41:16
