应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » 【求助】Forcite模拟怎么判断稳定性啊？
11/1返回列表
查看: 516  |  回复: 0
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

Gina88

木虫 (正式写手)

[交流] 【求助】Forcite模拟怎么判断稳定性啊？

我模拟一个结构退火。

先纯粹的模拟结构退火。
然后考虑到表面悬挂键可能重构。所以就人工搭上键了。然后进行和上面一摸一样的退火。

那我怎么判断这个结构是应该有重构，还是不应该有重构呢？

     还有，记得有人曾经说过，温度和速度有关，速度和动能有关，如果加温度，就可以找到全局最小值。那我退火之后，文件夹中第一个后缀名为.xsd的就是势能为全局最小值的结构吗？

     看了quench是1次dynamics+1次geometry optimization；
     anneal是多次（dynamics+geometry optimization），或者是多次dynamics+1次geometry optimization。其中，每次dynamics的温度都是不一样的，在变化的。
     那既然dynamics中温度和速度成比例。quench中一次将温度加够，也即速度加够，也就能找到势能全局最小值的结构了。那forcite中要anneal还有什么用呢？

     非常非常感谢！

[ Last edited by Gina88 on 2011-4-13 at 09:27 ]
回复此楼

» 猜你喜欢

» 抢金币啦！回帖就可以得到:

查看全部散金贴
1楼 2011-04-12 09:42:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 Gina88 的主题更新
11/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭