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Gina88

木虫 (正式写手)


[交流] 【求助】Forcite模拟怎么判断稳定性啊?

我模拟一个结构退火。

先纯粹的模拟结构退火。
然后考虑到表面悬挂键可能重构。所以就人工搭上键了。然后进行和上面一摸一样的退火。

那我怎么判断这个结构是应该有重构,还是不应该有重构呢?

     还有,记得有人曾经说过,温度和速度有关,速度和动能有关,如果加温度,就可以找到全局最小值。那我退火之后,文件夹中第一个后缀名为.xsd的就是势能为全局最小值的结构吗?

     看了quench是1次dynamics+1次geometry optimization;
     anneal是多次(dynamics+geometry optimization),或者是多次dynamics+1次geometry optimization。其中,每次dynamics的温度都是不一样的,在变化的。
     那既然dynamics中温度和速度成比例。quench中一次将温度加够,也即速度加够,也就能找到势能全局最小值的结构了。那forcite中要anneal还有什么用呢?

     非常非常感谢!

[ Last edited by Gina88 on 2011-4-13 at 09:27 ]
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