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yxdhd铜虫 (小有名气)
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[交流]
【求助/交流】请教生物信息学的同学，急
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最近在做序列同源性比对和基因进化树。 因为牵扯到用sequence divergence 临界值分型，但同时有得用MEGA 4（发表文章用得比较多的）画分型的进化树。但MEGA 4中只能比对出pawise distance。 1.请教pawise distance 与sequence divergence有相关性么？ 比如进化树采用.MEGA 4，同时也计算了pawise distance，但同一款软件哪里可以看出sequence divergence？或者pawise distance 与sequence divergence之间有换算关系么？ 2.如果用DNA star计算的sequence divergence值去衡量MEGA 4中进化树序列之间的异源性，这样可行么？ |
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