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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Siesta&Smeagol&Atk » 【求助】怎么将siesta中的静电势ElectrostaticPotential的数据导出啊
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伐木工

木虫 (初入文坛)

[交流] 【求助】怎么将siesta中的静电势ElectrostaticPotential的数据导出啊

如题，我刚刚学习siesta，想计算一下静电势，按照manu上将SaveElectrostaticPotential 设为True，可是计算成功后如何将有效势画成曲线呢，从哪里看静电势的数据啊
谢谢高手帮忙啦
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1楼 2011-04-02 20:18:53
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伐木工

木虫 (初入文坛)
引用回帖:
Originally posted by zhangguangping at 2011-04-02 21:56:33:
参照下面的两个帖子，估计会解决你的问题。
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=2482325
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=2386188
在那里，把电荷密度的文件替换为你现 ...

你好 谢谢你的回帖 这两个网址我仔细看过了 可是这里没有计算有效势的程序 我在siesta manu上看到说要用程序IORHO
Instructs to write the total electrostatic potential,
de ned as the sum of the hartree potential plus the local pseudopotential, at the mesh
used by DHSCF, in file SystemLabel.VH. This file can be read by routine IORHO, which may be used by an application program in later versions.
Use: File SystemLabel.VH is only written, not read, by siesta.
这是说现在的版本还不能处理有效势吗，可是在siesta原来的文献上不是计算了一个两个金电极 中间是真空层的有效势了吗 他们是怎么算的呢？有些迷茫了 请多多指教
赞一下 回复此楼
3楼2011-04-29 19:31:39
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zhangguangping

木虫 (著名写手)
★ ★
sunyang1988(金币+2): 谢谢指点 2011-04-02 22:44:38
伐木工(金币+10): 2011-04-03 09:38:59
引用回帖:
Originally posted by 伐木工 at 2011-04-02 13:18:53:
如题，我刚刚学习siesta，想计算一下静电势，按照manu上将SaveElectrostaticPotential 设为True，可是计算成功后如何将有效势画成曲线呢，从哪里看静电势的数据啊
谢谢高手帮忙啦

参照下面的两个帖子，估计会解决你的问题。
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=2482325
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=2386188
在那里，把电荷密度的文件替换为你现在的电势的文件.
赞一下(1人) 回复此楼
2楼2011-04-02 21:56:33
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zhangguangping

木虫 (著名写手)
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
gzqdyouxia(金币+2): 谢谢详细指导 2011-04-29 22:42:31
引用回帖:
Originally posted by 伐木工 at 2011-04-29 12:31:39:
你好 谢谢你的回帖 这两个网址我仔细看过了 可是这里没有计算有效势的程序 我在siesta manu上看到说要用程序IORHO
Instructs to write the total electrostatic potential,
de ned as the sum of the hartre ...

你不是已经有了.VH的文件了吗？如果你用第一个帖子的方法，可以将.VH文件中的数据转化成cube文件的格式，画等值面，等高线。
如果你用第二个帖子中我在7楼中附件中的程序，可以画出来某一条直线或者某一个平面，或者是某一个点上的电势的值。
当然，如果你只想沿着z方向画电势，但是对xy平面取平均，那么你需要利用siesta带的工具Macroave
我想你说的那个PRB,65,165401（2002）的文章中的图是用我说的第二种方法画的。
赞一下(2人) 回复此楼
4楼2011-04-29 20:29:12
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伐木工

木虫 (初入文坛)
谢谢

[ Last edited by 伐木工 on 2011-5-2 at 09:07 ]
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5楼2011-04-30 14:58:57
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