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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 【求助】MS中角度的设置 set
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5858797

木虫 (正式写手)

[交流] 【求助】MS中角度的设置 set 已有3人参与

MS 中角度的设置，是不是只能设置任意三个原子所成的角，能不能设置一个键和一个矢量间的夹角为一个set,然后看角度的分别，有篇文献，是这样做的，但不知道MS可不可以做这样的分析
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风雨路上，有你帮忙
1楼 2011-03-29 18:44:12
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zzy870720z

荣誉版主 (文坛精英)

优秀版主优秀版主优秀版主优秀版主
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
bingmou(金币+1): 感谢交流！ 2011-03-30 20:53:29
引用回帖:
Originally posted by 5858797 at 2011-03-29 20:50:02:
你会用MS中的质心这个吗？
这篇文章就是用MS做的，可以选界面为一个矢量，应该是set出来的吧？
Molecular Dynamics Simulations of SDS, DTAB, and C12E8 Monolayers
Adsorbed at the Air/Water Surface in ...

会不会是他们自己处理的，确定方向和R后就可以计算了
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博学、审问、慎思、明辨、笃学
4楼2011-03-29 22:31:21
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xujc1983

木虫 (著名写手)

苦逼青椒一枚
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
zzy870720z(金币+1): 谢谢回复 2011-03-29 22:30:34
貌似不可以吧，MS对于角、二面角的测量，都是基于选择原子的，键还好说，矢量怎么选择呢
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2楼2011-03-29 19:28:56
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5858797

木虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by xujc1983 at 2011-03-29 19:28:56:
貌似不可以吧，MS对于角、二面角的测量，都是基于选择原子的，键还好说，矢量怎么选择呢

你会用MS中的质心这个吗？
这篇文章就是用MS做的，可以选界面为一个矢量，应该是set出来的吧？
Molecular Dynamics Simulations of SDS, DTAB, and C12E8 Monolayers
Adsorbed at the Air/Water Surface in the Presence of DSEP

里面可以选择面对称，轴对称等等，能不能选自己想要的方向呢？
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风雨路上，有你帮忙
3楼2011-03-29 20:50:02
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5858797

木虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by zzy870720z at 2011-03-29 22:31:21:
会不会是他们自己处理的，确定方向和R后就可以计算了

不知道，一直在想，想通了　总结下
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风雨路上，有你帮忙
5楼2011-03-30 20:32:31
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