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项目编号: 31071111 项目名称: 我国鼠疫耶尔森氏菌东方型菌株基因组多态性及微进化的研究 项目类型: 面上项目 申报学科: 比较基因组与进化(C060502)、比较基因组与进化(C010603) 研究性质: 基础研究 资助金额: 35 万元 依托单位: 中国人民解放军军事医学科学院 项目负责人: 宋亚军 开始日期: 2011-01-01 完成日期: 2013-12-31 项目摘要: 目前国际鼠疫研究者普遍认为,第三次世界鼠疫大流行起源于中国,其病原体鼠疫耶尔森氏菌东方型菌株起源于云南。而我们基于SNP分型和大规模基因组测序的结果却不完全支持东方型菌株的云南起源假说。本课题拟选择300株左右的我国东方型鼠疫菌株(主要来自云南、广西和贵州等地),利用SNP分析、MLVA分析、CRISPR分析等技术手段,全面研究其基因组多态性,建立我国东方型鼠疫菌株基因组多态性数据库;解析我国东方型鼠疫菌株的精细群体遗传学结构和基因组微进化路线;并结合菌株的地理信息和流行病学数据,以谱系生物地理学的研究思路,勾勒东方型菌株基因组多态性与鼠疫疫源地扩散之间的联系。通过本课题的研究,预期将可以解答鼠疫菌东方型菌株的起源问题,并探讨东方型菌株在我国(云南省内以及由云南邻近省份)扩散的规律;进而为特定生物型菌株的检测、菌株溯源以及鼠疫疫情控制等工作提供基础性数据。 |
2楼2011-02-19 11:45:31














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