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【摘要编号】30900985
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全基因组关联作图结合转录组分析发掘长豇豆耐热/旱候选基因 |
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jinzhao__(金币+4, 基金HEPI+1): 2011-01-30 08:40:27
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【答案】应助回帖 项目编号 30900985 项目名称 全基因组关联作图结合转录组分析发掘长豇豆耐热/旱候选基因 项目类型 青年科学基金项目 申报学科1 (C1502) 申报学科2 (C130410) 研究性质 基础研究 资助金额 20.00万元 开始日期 2010年1月1日 完成日期 2012年12月31日 项目摘要 热/旱胁迫引起长豇豆大量落花落荚，产量和品质下降。本项目在鉴定我国主要长豇豆种质耐热/旱性的基础上，利用与美国加州大学合作的cSNP分析平台，从全基因组水平检测96份代表性材料1536个cSNP位点的基因型；通过对标记连锁不平衡的分析揭示长豇豆基因组的连锁不平衡特征；通过基因型与耐热/旱表型关联分析，鉴定与耐热/旱性显著关联的cSNP位点。同时，利用普通豇豆EST序列设计引物进行PCR扩增，创制首张豇豆基因芯片，在耐与不耐热/旱长豇豆种质间比较鉴定热/旱胁迫响应基因，勾绘与耐热/旱性相关的主要或特异代谢途径。在此基础上，利用豇豆-模式豆类比较基因组分析这一桥梁，在关联作图鉴定的显著性位点附近进一步精细分析、寻找与已鉴定的耐热/旱代谢途径有关的基因，确定出耐热/旱候选基因。研究结果对了解长豇豆连锁不平衡特征、发掘育种目标基因及其等位变异有重要意义，也是下一步开展候选基因功能分析的基础。 获资助单位 浙江省农业科学院(项目负责人) |
2楼2011-01-29 20:25:57