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【摘要编号】81001287/ H2611
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81001287/ H2611 基于复杂疾病全基因组关联数据识别易感位点和基因（环境）交互作用的贝叶斯方法研究 |
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zaneping(金币+4, 基金HEPI+1): 2011-01-25 17:04:28
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项目详情 项目编号 81001287 项目名称 基于复杂疾病全基因组关联数据识别易感位点和基因（环境）交互作用的贝叶斯方法研究 项目类型 青年科学基金项目 申报学科1 流行病学方法与卫生统计(H2611) 研究性质 应用基础研究 资助金额 20.00万元 开始日期 2011年1月1日 完成日期 2013年12月31日 项目摘要 本研究针对全基因组关联研究数据的特点及传统频率学方法的诸多限制，引入贝叶斯因子方法筛选与疾病相关的SNP位点，利用Monte-Carlo模拟，在不同的遗传模式、样本量及SNP密度条件下，与传统的多重检验方法假阳性发现率（FDR）进行全面系统的比较，选择一种稳定性及准确性较高的方法进行疾病相关易感位点选取，同时，确定基因（环境）互作网络的变量域。针对目前实验研究无法识别基因（环境）交互作用的现状，本研究在前期研究的基础上提出利用改进的决策树ID3算法结合贝叶斯网络K2算法构建基因（环境）相互作用的贝叶斯网络，并且与多因子降维方法进行比较，利用Monte-Carlo方法和bootstrap技术对两种模型进行评价。最终确定不同条件下GWAS数据分析策略。将上述方法模型用于全基因组关联分析实际数据中识别易感位点和基因（环境）的交互作用，为复杂疾病的遗传学研究提供算法支持。 获资助单位 中国人民解放军第二军医大学(项目负责人) |
2楼2011-01-25 16:42:10