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【摘要编号】31000582/C0607
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基于生物网络模块的高通量表达谱差异分析 |
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book2005593
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pku123(金币+4, 基金HEPI+1): 2011-01-20 22:23:20
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项目编号 31000582 项目名称 基于生物网络模块的高通量表达谱差异分析 项目类型 青年科学基金项目 申报学科1 生物信息学(C0607) 申报学科2 生物信息学(C060703) 研究性质 基础研究 资助金额 22.00万元 开始日期 2011年1月1日 完成日期 2013年12月31日 项目摘要 基因芯片与串联质谱分别是目前转录组、蛋白质组研究最主要的高通量分析手段。代谢通路等分子互作信息与基因芯片表达谱的整合已被证实可提高表达差异分析的统计效力、重复率和数据解释性。但是目前的方法存在生物网络基因覆盖率不足，未考虑网络拓扑结构变异等问题。特别是对复杂的蛋白质组数据，尚未见基于生物网络模块或代谢通路的差异分析方法被报道。因此，我们就基于生物网络，特别是蛋白互作网络模块进行高通量表达谱差异分析的方法建立、方法评估及软件开发等问题展开研究：（1）整合不同来源的数据，构建最新的蛋白相互作用网络，并进行模块结构解析。（2）将基因覆盖度更广的蛋白相互作用网络引入到基因芯片的差异分析中，以期探究新的相关功能模块。（3）首次提出适合蛋白质谱数据的、基于蛋白相互作用网络模块的统计模型，并对模型的准确性和稳定性等进行方法评估。（4）开发相应的有图形界面的分析工具，提供基于网络模块结构表达谱的差异分析。 获资助单位 上海交通大学(项目负责人) |
2楼2011-01-20 22:15:54