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pku123

金虫 (正式写手)


[交流] 【摘要编号】31071158/C060703

求助摘要的编号:
31071158/C060703
项目名称:
肿瘤相关基因可变剪接数据库构建及功能探寻
项目类型:
面上

肿瘤相关基因可变剪接数据库构建及功能探寻

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wg423(金币+4, 基金HEPI+1): 2011-02-27 14:01:00
项目编号 31071158
项目名称 肿瘤相关基因可变剪接数据库构建及功能探寻  
项目类型 面上项目   
申报学科1 生物信息的整合及信息挖掘(C060703)  
申报学科2 生物信息的整合及信息挖掘(C060605)  
研究性质 基础研究   
资助金额 35.00万元
开始日期 2011年1月1日  
完成日期 2013年12月31日   
项目摘要 可变剪接是重要的基因表达与基因功能精细调控的方式之一,并在高等动物中普遍存在。一些重要基因不同转录本的功能差异直接影响疾病进程,包括肿瘤。其内在机制有可能与不同转录本的蛋白理化性质或蛋白结构域改变,以及这些转录本的时空表达有关。区别观察基因的不同可变剪接形式与表型的相关性,可以从一个独特的角度对基因功能进行探寻,并且可以避免或澄清先前一些互相矛盾的研究结果。 本研究拟收集比较肿瘤相关基因不同转录本之间的差异,预测已知的蛋白结构域,并通过比较基因组手段预测可能具重要功能的基因区段,建立肿瘤相关基因的可变剪接数据库。从中筛选出功能结构域因可变剪接而变化的基因。而后在常见癌症样本cDNA文库中检测同一基因不同转录本的表达情况。进而根据其蛋白结构域功能特点,设计功能实验与裸鼠肿瘤模型进行验证。期望探寻可变剪接影响肿瘤进程的相关作用机制,并建立以选择性剪接为切入点,分析疾病基因功能的研究模式。  
获资助单位 复旦大学(项目负责人)
2楼2011-01-20 22:12:30
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