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【摘要编号】31071158/C060703
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肿瘤相关基因可变剪接数据库构建及功能探寻 |
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book2005593
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wg423(金币+4, 基金HEPI+1): 2011-02-27 14:01:00
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项目编号 31071158 项目名称 肿瘤相关基因可变剪接数据库构建及功能探寻 项目类型 面上项目 申报学科1 生物信息的整合及信息挖掘(C060703) 申报学科2 生物信息的整合及信息挖掘(C060605) 研究性质 基础研究 资助金额 35.00万元 开始日期 2011年1月1日 完成日期 2013年12月31日 项目摘要 可变剪接是重要的基因表达与基因功能精细调控的方式之一，并在高等动物中普遍存在。一些重要基因不同转录本的功能差异直接影响疾病进程，包括肿瘤。其内在机制有可能与不同转录本的蛋白理化性质或蛋白结构域改变，以及这些转录本的时空表达有关。区别观察基因的不同可变剪接形式与表型的相关性，可以从一个独特的角度对基因功能进行探寻，并且可以避免或澄清先前一些互相矛盾的研究结果。 本研究拟收集比较肿瘤相关基因不同转录本之间的差异，预测已知的蛋白结构域，并通过比较基因组手段预测可能具重要功能的基因区段，建立肿瘤相关基因的可变剪接数据库。从中筛选出功能结构域因可变剪接而变化的基因。而后在常见癌症样本cDNA文库中检测同一基因不同转录本的表达情况。进而根据其蛋白结构域功能特点，设计功能实验与裸鼠肿瘤模型进行验证。期望探寻可变剪接影响肿瘤进程的相关作用机制，并建立以选择性剪接为切入点，分析疾病基因功能的研究模式。 获资助单位 复旦大学(项目负责人) |
2楼2011-01-20 22:12:30