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pku123

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[交流] 【摘要编号】61072149/F010809

求助摘要的编号:

61072149/F010809

项目名称:

重建时变结构的基因调控网络的模型和算法及在糖尿病研究中的应用

项目类型:

面上

重建时变结构的基因调控网络的模型和算法及在糖尿病研究中的应用

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1楼 2011-01-19 22:19:30

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book2005593

主管区长 (文坛精英)

★ ★ ★
pku123(金币+1, 基金HEPI+1): 2011-01-26 10:32:44
wg423(金币+3): 2011-02-27 14:02:09

项目编号 61072149
项目名称重建时变结构的基因调控网络的模型和算法及在糖尿病研究中的应用
项目类型面上项目
申报学科1 系统生物学理论与技术(F010809)
申报学科2 系统生物学理论与技术(C0505)
研究性质应用基础研究
资助金额 34.00万元
开始日期 2011年1月1日
完成日期 2013年12月31日
项目摘要本项目的研究内容为集成大规模高通量生物数据，利用计算模型在基因、转录因子、及其活性度的三个层次上重建基因、蛋白质和小分子化合物之间的时变及条件依存结构的调控网络。也即，(1)集成时序列microarray等数据，提出时变或条件依存结构的基因调控网络重建模型和算法，并推导出条件或环境与基因调控强度的定量关系。(2)集成时序列microarray、ChIP-chip等数据，提出时变或条件依存结构的转录调控网络重建模型和算法。(3)集成时序列microarray、ChIP-chip、蛋白质相互作用及各种异源生物数据，提出转录因子活性化网络重建模型和算法。并对糖尿病动物模型，由三个层次的基因网络，在系统的角度上研究在糖尿病不同发展阶段中转录因子之间的协作关系，推断与条件或调控过程密切相关的活性网络、信号传导通路及网络生物标记。
获资助单位中国科学院上海生命科学研究院(项目负责人)

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