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dengminghua

木虫 (著名写手)


[交流] 【摘要编号】81073001/H2802

求助摘要的编号:
81073001/H2802
项目名称:
石斛属药用植物DNA条形码复合序列鉴定研究
项目类型:
面上

石斛属药用植物DNA条形码复合序列鉴定研究
81073001/H2802
姚辉
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raimi

铁杆木虫 (著名写手)


dengminghua(金币+4, 基金HEPI+1): xiexie 2011-01-18 13:55:14
项目编号 81073001
项目名称 石斛属药用植物DNA条形码复合序列鉴定研究  
项目类型 面上项目   
申报学科1 中药鉴定(H2802)  
研究性质 基础研究   
资助金额 33.00万元
开始日期 2011年1月1日  
完成日期 2013年12月31日   
项目摘要 以往的DNA条形码序列筛选研究在取样上尺度较大,而对具体类群的研究较少,1个科或1个属只用很少的种类作为代表。DNA条形码的应用主要集中在属内物种水平,而生物条形码协会建议的植物DNA条形码rbcL和matK序列分子进化速率较慢,在种级水平上分辨率较低。申请者前期研究表明matK序列不能有效鉴定石斛属物种,本研究拟对石斛属叶绿体和核基因DNA条形码候选序列进行综合评价,通过PCR扩增效率,不同序列的测序效率和测序质量,种内/种间遗传距离,种内最大、种间最小遗传距离进行比较,确定种间鉴定的阈值;以Wilcoxon Signed Rank Tests等方法对不同序列在种内和种间的变异性大小统计学检验;对不同序列进行barcoding gap分析,以BLAST等方法评价不同序列的鉴定效率,建立石斛属药用植物DNA条形码复合序列鉴定体系,为石斛属药用植物鉴定、生物多样性和资源保护研究提供依据。  
获资助单位 中国医学科学院(项目负责人)
2楼2011-01-18 13:16:27
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