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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 【求助】怎样考虑气体分子在纳米管或石墨烯上的物理吸附？（急）
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lwg020810

金虫 (小有名气)

[交流] 【求助】怎样考虑气体分子在纳米管或石墨烯上的物理吸附？（急）

在计算气体分子在一维或二维纳米材料上吸附时，既要考虑物理吸附又要考虑化学吸附，化学吸附的稳定构型通过几何优化容易得到，但是物理吸附的最低能量结构怎么得到？
我重复了一篇文献中的物理吸附，直接拿文献中提到的稳定构型几何优化，结果是纳米管出现了严重的形变，我查找了另一些文献，文中有提到做物理吸附势能面，用DMol这个势能面又要怎么做？
请各位大侠指点
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1楼 2011-01-16 10:55:24
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study163

木虫 (正式写手)
★
zzy870720z(金币+1): 鼓励交流 2011-01-18 16:39:47
lwg020810(金币+2): 谢谢指点，我考虑使用constrain管也能得到稳定吸附，不知是否可以，JMC，20，10426 2011-01-18 21:49:39
物理吸附不应该出现碳管出现大的变形啊，你看的是哪篇文章？
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2楼2011-01-18 15:46:45
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frank_zhan

金虫 (正式写手)
★
zzy870720z(金币+1): 谢谢指教 2011-01-18 21:31:45
lwg020810(金币+2): 物理吸附相互作用力主要是vdW力，考虑相关原子的vdW半径就应该可以吧 2011-01-18 21:45:23
计算物理吸附的时候，应该是要注意控制吸附气体和表面的距离吧。
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3楼2011-01-18 20:18:52
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qphll

金虫 (正式写手)
★ ★ ★
zzy870720z(金币+3): 谢谢详细指教 2011-01-25 09:03:47
引用回帖:
Originally posted by frank_zhan at 2011-01-18 20:18:52:
计算物理吸附的时候，应该是要注意控制吸附气体和表面的距离吧。

同意.

考虑物理吸附的势能面, 可以从很远处(大于10angstrom)将分子逐步移动靠近碳管, 然后在每个距离点上做fix point optimization, 这样得到能量与距离的曲线.

比如, 如果计算CO2

D = 10.0 A , 固定CO2的COM和碳管表面某C原子的距离,  然后geometry optimization, 得到E1;

D= 9.5 A, 固定CO2的COM和碳管表面某C原子的距离,  然后geometry optimization, 得到E2;


D= 9.0 A, 固定CO2的COM和碳管表面某C原子的距离,  然后geometry optimization, 得到E3;

.... 以此类推....

修改VDW参数, 可以相同距离下, 不同VDW气体的吸附强弱. 但是不要忘记, DFT对于dispersion的描述, 是天生的一个'缺陷'. 似乎现在还没有完美解答....
所以修改VDW参数得到的比较, 只是一个参考值.
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4楼2011-01-25 06:21:48
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小虫_sang

铁虫 (正式写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
4楼: Originally posted by qphll at 2011-01-25 06:21:48
同意.

考虑物理吸附的势能面, 可以从很远处(大于10angstrom)将分子逐步移动靠近碳管, 然后在每个距离点上做fix point optimization, 这样得到能量与距离的曲线.

比如, 如果计算CO2

D = 10.0 A , 固定C ...

请问怎么固定CO2到碳管距离，然后进行优化呢？是在“modify-constraints”中设置的吗？请教具体操作？？
另外，此距离是指CO2质量中心到碳管的距离吧？
谢谢~
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5楼2014-04-03 17:09:50
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xj200920075

银虫 (正式写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
5楼: Originally posted by 小虫_sang at 2014-04-03 17:09:50
请问怎么固定CO2到碳管距离，然后进行优化呢？是在“modify-constraints”中设置的吗？请教具体操作？？
另外，此距离是指CO2质量中心到碳管的距离吧？
谢谢~...

您好，您的这个帖子已经有很长一段时间了，问题估计早解决了，请问下，您的问题是怎么解决的啊，固定后是通过哪一个模块进行优化的啊，谢谢了！
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6楼2015-02-03 16:02:56
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