| 查看: 2441 | 回复: 16 | |||
[交流]
【交流】能否有小木虫版的linux？ 已有13人参与
|
|||
|
在小木虫中，各种专业软件在Linux平台的编译、安装是主要的话题之一，也涉及到大家不少的精力。 能否有虫友或者合作群体把诸如gromacs、autodock这些常用的工具软件编译、安装好后，再打包形成DVD安装文件。 现在，每个新人都要学习如何安装Linux-最痛苦的是要忍受必须联网下载有关文件包的麻烦，尤其是在高校各种上网认证程序管理下，Linux livecd形同摆设，很难联上网，这样后续的下载更谈不上。 结果是，对外宣称一张CD走天下，结果是还需要更多的文件下载才能形成完整的系统。如果要线下完整安装，那还得去找DVD盘，Ubuntu DVD可是有4G之巨；也不知道里面究竟有什么弄得这么大？ 把Linux基本系统捣腾过后，才是应用软件的编译、安装，这中间又出现“Linux依赖”等，还能网上四下寻找。Linux这种严重依赖网络的主流安装方式，难道不是一种局限和风险？要是哪天网络故障或者强力集团有意断网，大家就不用干活？ 而且，这样的不断网络升级，难道没有什么后门程序之类的？再是开源，能有多少人看得懂代码？ 现在看来，Linux服务业确有必要，北京的那个喀纳斯自由软件有点意思，可惜也就只是关心中文基础系统的安装，没有涉及专业软件工具。 国外以前出现过biolinux之类的预安装发行版，但是里面的应用软件有限，而且多数不是主流软件。 因此，不知虫友中可否有人能进行这方面的尝试？把Ubuntu里面的娱乐等软件除去，加上计算模拟软件。这样，有利于Linux理念在大学的流行，有利于更多的新人使用Linux环境解决实际问题。 [ Last edited by mingdong on 2011-1-13 at 13:31 ] |
回复此楼» 猜你喜欢
基金申请
已经有44人回复
-
CSC与新西兰维多利亚大学PhD奖学金项目
已经有0人回复
-
物理学I论文润色/翻译怎么收费?
已经有295人回复
-
新西兰Robinson研究所 招聘CSC公派访问人员
已经有0人回复
-
帮我的英语口语老师找学生
已经有0人回复
-
什么时候开奖？
已经有13人回复
-
散金币祈福
已经有94人回复
-
青基已中
已经有1人回复
-
散金币祈福
已经有185人回复
-
求助，如何提取ELK的rt-TDDFT在某一时刻的自旋密度分布和电子密度分布
已经有1人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 嵌入式Linux应用程序开发详解(完整版).
已经有174人回复
|
做计算模拟的，总是有些朋友对于图形界面深恶痛绝，好像是个主义之分、路线斗争。其实，估计与学科背景有关，多数做计算模拟的是物理、物理化学等专业出身，习惯处理简单、理想体系了，这时用命令行自然有特长。 但是，随着计算模拟理念的普及，越来越多实验出身的人、尤其是有机化学、分子生物学专业的人开设涉及计算模拟，这时如果还是坚持百分之百的命令行，那输入文件的编写都成问题。比如，药物分子模拟中，涉及到的是分子量200-500左右的有机分子，如果完全用指令行、内坐标编写，估计自己都要糊涂。而要是再涉及到大分子，那就更难了。我们现在的日常工作就涉及到环糊精包合物的计算，这个总不能一定要求用文字界面干全部工作吧。 其实，在使用过程中，比如rietvald精修时，我们也认识到了命令行输入特定参数的好处。但是，用命令行输入分子晶体的坐标就是一个困难，这时图形界面就有很大的用处。 稍微有点跑题，还是回到定制Linux上。 首先，印度人制作了一个Open Discovery，是基于fedora的，里面就集成了pymol、gromacs和autodock 、vina等。1.0、2.0版本免费下载，3.0学术版收费35美元。我大概看了下，它采取的方式是下载人自行去取得各个应用软件的使用许可。这或许是一个不错的实施模式。 另外，还有一个scientific linux，里面也装了不少的应用程序库，中文也做得不错，正在下载，准备试试。可惜，这个版本是从事高能物理的科学家主导的，什么时候有从事计算化学的科学家主导一个Dirac Linux就好了。 |
6楼2011-01-14 10:59:41
abbott
金虫 (著名写手)
不要用QQ问我东西
- 计算强帖: 1
- 应助: 16 (小学生)
- 金币: 1071.6
- 散金: 2787
- 红花: 10
- 帖子: 1015
- 在线: 105.2小时
- 虫号: 452267
- 注册: 2007-11-05
- 性别: GG
- 专业: 计算机硬件技术
2楼2011-01-13 08:24:06
 |
3楼2011-01-13 08:49:19
cationly
木虫 (正式写手)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 3178.6
- 红花: 1
- 帖子: 514
- 在线: 61.2小时
- 虫号: 355525
- 注册: 2007-04-25
- 专业: 凝聚态物性 II ：电子结构
4楼2011-01-13 10:08:33
5楼2011-01-13 10:14:01
wangww2011
木虫 (著名写手)
- 应助: 11 (小学生)
- 金币: 4023.1
- 散金: 2709
- 红花: 18
- 沙发: 1
- 帖子: 1915
- 在线: 1537.1小时
- 虫号: 772953
- 注册: 2009-05-17
- 性别: GG
- 专业: 凝聚态物性 II ：电子结构
7楼2011-01-16 12:23:26
liuyulong
金虫 (小有名气)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 1401.9
- 散金: 100
- 红花: 2
- 帖子: 260
- 在线: 290.4小时
- 虫号: 403288
- 注册: 2007-06-15
- 专业: 药物化学
8楼2011-01-16 12:51:48
9楼2011-01-18 02:30:15
10楼2011-01-18 03:00:50
30