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masc8868

银虫 (小有名气)

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[交流] 【摘要编号】31070098/C010501

求助摘要的编号:

31070098/C010501

项目名称:

一种乙酸氧化菌的单细胞基因组研究

项目类型:

NSFC

【求助者id】masc8868
【求助摘要的编号】31070098/C010501
【求助数量】1

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1楼 2011-01-12 11:58:22

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jyzh19801012

铜虫 (小有名气)

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masc8868(金币+4, 基金HEPI+1): 2011-01-17 21:37:17

项目编号 31070098
项目名称一种乙酸氧化菌的单细胞基因组研究
项目类型面上项目
申报学科1 陆生环境微生物学(C010501)
申报学科2 陆生环境微生物学(C010301)
研究性质基础研究
资助金额 40.00万元
开始日期 2011年1月1日
完成日期 2013年12月31日
项目摘要在许多特殊的厌氧环境中存在一类乙酸氧化菌，它们与氢营养型甲烷菌互生、将乙酸转化为氢气与二氧化碳。目前只有四株这类乙酸氧化菌得到过纯培养，对这四株菌的初步研究表明，它们的生理生化特性及系统发育地位具有较大的多样性。目前由于缺少这类菌的基因组信息，尚无法了解它们在乙酸氧化代谢途径上的共性和特异性。本项目将从一个具有乙酸氧化产氢功能的混合培养物出发，利用流式细胞仪分选和多重置换全基因组扩增技术，获得乙酸氧化菌单细胞的全基因组DNA，分析基因组序列并注释其功能基因，解析其氧化乙酸产氢的代谢途径及关键酶基因。并通过RT-PCR监测这些基因在混合培养物氧化乙酸过程中的表达水平，验证其功能。研究结果不仅为更好地认识乙酸氧化菌的遗传特性积累基础数据，也为进一步分析环境中同类型乙酸氧化菌的生态学特性提供参考基因组或分子标记。对氧化乙酸产氢代谢途径的解析，也将为开发底物全程利用的产氢技术提供新思路。
获资助单位中国科学院上海生命科学研究院(项目负责人)