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vegetking

铁杆木虫 (正式写手)

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[交流] 【摘要编号】31000560/C0605

求助摘要的编号:

31000560/C0605

项目名称:

利用ssRNA-seq技术开展水稻转录组的功能研究

项目类型:

青年基金项目

求助基金摘要：31000560/C0605 利用ssRNA-seq技术开展水稻转录组的功能研究陆婷婷中国科学院上海生命科学研究院 20万
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1楼 2011-01-11 21:04:11

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book2005593

主管区长 (文坛精英)

vegetking(金币+1, 基金HEPI+1):优秀 2011-01-11 21:14:11
vegetking(金币+3): 2011-01-13 12:52:42

项目编号 31000560
项目名称利用ssRNA-seq技术开展水稻转录组的功能研究
项目类型青年科学基金项目
申报学科1 基因组学(C0605)
申报学科2 基因组学(C0607)
研究性质基础研究
资助金额 20.00万元
开始日期 2011年1月1日
完成日期 2013年12月31日
项目摘要水稻是世界上最主要的粮食作物之一，也是重要的单子叶模式植物。水稻基因组测序完成后，其中一个重要的研究任务就是开展水稻全基因组的转录组分析。而不论是大规模cDNA克隆技术（表达序列标签EST和全长cDNA），还是芯片技术都尚未能全面阐述水稻转录组的复杂结构与功能。本研究将利用新一代测序技术（strand-specific RNA-seq,ssRNA-seq）对粳稻日本晴7-9个不同组织的微量mRNA进行高通量测序，充分利用新技术的特点开展水稻转录组的基因剪切位点及选择性剪切模式、反义RNA、非编码转录活性区域以及不同组织基因表达差异的比较研究，并且构建相应的水稻转录组公共数据库。该研究的优势在于能充分利用成熟的高通量测序技术平台和生物信息学组高通量测序数据分析的经验,低成本、快速但更全面和准确的分析水稻转录组的结构与功能。
获资助单位中国科学院上海生命科学研究院(项目负责人)

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