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convenient

铁虫 (小有名气)

[交流] 【求助】急需帮忙 已有4人参与

用CASTEP优化计算,停电后如何接着优化?一周内停电两次悲哀啊!希望高手指点。
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认真生活
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xianggui7895

银虫 (小有名气)

★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
youzhizhe(金币+5): 谢谢交流。 2011-03-20 14:12:12
首先声明,最省事的方法是对未优化完的模型接着优化,保持计算参数不变(相当于多步优化嘛)。

其次,可以接着断电前的计算继续,但是有条件的。要想castep能够断电后重用原来的计算结果继续跑,要满足下面的条件:

    1- check文件存在。

    2- check文件是健全。

或者说,check文件中至少又一次完整而成功的 num_backup_iter
  所定义的 几何优化或分子动力学 计算完成的条件下,相应的计算结果才能被写入check文件。

默认的行为,对于几何优化来说,是每五步bfgs完成后,才会执行一次check文件写入操作,这个行为是靠下面的参数控制的:

num_backup_iter

所以,如果对于每一步都很耗时的计算来说,最好在param文件中作下面的设定:

num_backup_iter : 1

即使如此,有的时候我们能够看到check文件,也不能保证此check文件时可用的,用数据库的语言来说,其中存在“脏数据”。这时候,可以看一下,在计算的结果目录中,是否还有一个.check_bak(似乎是这个名字或类似的名字)存在,这个是castep为了防止check文件由于意外的不可抗力造成的损坏而定时对check文件自动备份得到的。
如果这个文件存存在,只要删除原来的check文件,然后将此文件改名为check文件的名字,既可。

3- 如果上面的两个条件都已经满足,则只需要在param文件中仅仅使用下面的一行,就可以了:

continuation : seedname.check

这里的seedname,就是你的job的名字。

还可以看看这个帖子:http://muchong.com/html/200807/903708.html

[ Last edited by xianggui7895 on 2010-12-29 at 13:42 ]
6楼2010-12-29 13:39:53
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cenwanglai

荣誉版主 (知名作家)

老和山猥琐派九段

优秀版主

★ ★ ★
ellsaking(金币+3):谢谢指导~ 2010-12-29 13:13:05
找找help。

基本操作问题help中有详细说明。

在任务文嘉文本最后一行添加上
CONTINUATION : default。

然后保存 run file.

细节忘记了。自己也可以baidu一下。

[ Last edited by cenwanglai on 2010-12-29 at 11:07 ]
2楼2010-12-29 11:06:06
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薛金祥

金虫 (小有名气)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
ellsaking(金币+1):谢谢交流~ 2010-12-29 13:13:13
要是有话结构的话,你可以在优化了一半的结构上再接着优化,反正最后的结构都是一样的
3楼2010-12-29 11:16:16
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convenient

铁虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by cenwanglai at 2010-12-29 11:06:06:
找找help。

基本操作问题help中有详细说明。

在任务文嘉文本最后一行添加上
CONTINUATION : default。

然后保存 run file.

细节忘记了。自己也可以baidu一下。

[ Last edited by cenwanglai on  ...

谢谢
认真生活
4楼2010-12-29 13:00:25
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