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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 【求助】castep 建模
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哭泣的luotuo

金虫 (正式写手)

[交流] 【求助】castep 建模

一.在利用castep建模时，是不是既要计算了能量后还要对其模型进行结构优化啊？
二.我将自己简历的模型强加对称性后，发现模型中原子的位置发生了变化，原来建立的面心立方结构变成了体心立方结构，这个是说我的模型建错了还是怎么回事啊？
三.我在建立模型时，引入了一个一个原子的晶体结构，然后make P1后，将其中一个原子替换成另一个原子，期望求得这个原子和原晶体结构中原子的相互作用力。但是我发现每次我通过这种方式建立模型时，尽管只希望替换一个原子，但是与其相对的原子也同样会被替换掉，请问这是怎么回事啊？


这是我在建立模型时遇到的几个问题，请高手们能指点下，谢谢大家了
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1楼2010-12-28 22:00:10
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yindeqiang

银虫 (正式写手)
★ ★ ★
zzy870720z(金币+3):谢谢指点 2010-12-29 08:10:02
哭泣的luotuo(金币+3):谢谢 2010-12-29 09:41:55
哭泣的luotuo(金币+1):我对你的话是这样理解的，请看下对吗? 1,建立了模型后，需要进行结构优化，然后计算优化的能量 3.在我的模型里，我自己没有引入对称性，只是开始make P1了一下，本来只点了一个原子，但是与这个原子相对的原子也被替换了，有没有可能是make P1了仍然后某种对称性存在啊 ？谢谢了 2010-12-29 09:42:53
根据自己的理解说一下，仅供参考：
1).建模后，进行优化是系统的能量最低，即建立的模型更符合真实情况，你建立的优化前模型只是根据自己的理解或者其他，是比较理想化的模型，所以还是需要进行结构优化，而能量取的也应该是优化后的能量；
2).模型施加对称性后，原子位置发生变化，这个没有遇到过，还请虫友们讨论；
3).原子替换后，再MAKE P1去掉对称性后，可以替换任一原子，你的这个问题，是否是由于引入对称性的先后顺序引起的。
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2楼2010-12-29 04:13:29
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哭泣的luotuo

金虫 (正式写手)
cenwanglai:引用前面的帖子再回复后，被引用的人就会收到一个通知贴。不用在前面的回复帖中把你后面的问题再列一边。 2010-12-29 12:41:14
引用回帖:
Originally posted by yindeqiang at 2010-12-29 04:13:29:
根据自己的理解说一下，仅供参考：
1).建模后，进行优化是系统的能量最低，即建立的模型更符合真实情况，你建立的优化前模型只是根据自己的理解或者其他，是比较理想化的模型，所以还是需要进行结构优化，而能量 ...

我对你的话是这样理解的，请看下对吗?
1,建立了模型后，需要进行结构优化，然后计算优化的能量
3.在我的模型里，我自己没有引入对称性，只是开始make P1了一下，本来只点了一个原子，但是与这个原子相对的原子也被替换了，有没有可能是make P1了仍然后某种对称性存在啊 ？谢谢了。
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3楼2010-12-29 09:41:39
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cg陈

铁杆木虫 (著名写手)
学习一下哈
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4楼2010-12-29 12:35:42
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yindeqiang

银虫 (正式写手)
★ ★
youzhizhe(金币+2):谢谢交流。 2010-12-29 19:19:25
1).表达的是我的意思，优化后可以直接读到能量，不需要重新计算
2).make P1就是去对称性，如果你没有引入对称性，那么make P1后，你就可替换其中的任一原子
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5楼2010-12-29 19:14:57
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houfeifan

金虫 (小有名气)
★
zzy870720z(金币+1):谢谢指点 2011-01-10 18:55:55
哭泣的luotuo(金币+4):恩，是的，就是这样的，谢谢啊 2011-01-10 23:51:11
引用回帖:
Originally posted by 哭泣的luotuo at 2010-12-29 09:41:39:

我对你的话是这样理解的，请看下对吗?
1,建立了模型后，需要进行结构优化，然后计算优化的能量
3.在我的模型里，我自己没有引入对称性，只是开始make P1了一下，本来只点了一个原子，但是与这个原子相对的原子 ...

你标注的问题“3”：可能你选择的原子位于建立模型的边界上，所以你选择的原子和与之对应发生改变的原子实际上是同一个原子。
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6楼2011-01-10 15:05:48
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哭泣的luotuo

金虫 (正式写手)
请高手来看看第二个问题啊，我现在对这个问题很纠结啊。
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7楼2011-01-10 23:55:45
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薛金祥

金虫 (小有名气)
★ ★
zzy870720z(金币+2):谢谢指教 2011-01-11 12:41:59
哭泣的luotuo(金币+4):好像强加了对称性后，比较好的优势是由于对称性的存在使得计算机的计算次数降低了。加对称性和不加对称性对计算结果的影响感觉还是应该有的。谢谢你的交流 2011-01-12 19:10:10
引用回帖:
Originally posted by 哭泣的luotuo at 2011-01-10 23:55:45:
请高手来看看第二个问题啊，我现在对这个问题很纠结啊。

我进行对称后原来的单斜晶系也可以变成正交晶系，原子的位置也发生呢个了变化，但是各元素原子个数也都没有发生变话，对称调整后是软件根据模型做出的调整，影响应该不大，如果不放心可以建个小模型，对称前后的计算对比一下
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8楼2011-01-11 09:00:26
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