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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » CPMD/CP2K » 【求助】cpmd.x生成出来，但是不能运行，是怎么回事啊？
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zyj8119

木虫 (著名写手)

[交流] 【求助】cpmd.x生成出来，但是不能运行，是怎么回事啊？

[root@cluster SOURCE]# pgf90
-bash: pgf90: command not found
[root@cluster SOURCE]# pgif90
-bash: pgif90: command not found
[root@cluster SOURCE]# ./cpmd.x
./cpmd.x: error while loading shared libraries: libmkl_intel_lp64.so: cannot open shared object file: No such file or directory
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1楼 2010-12-28 16:23:00
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zyj8119

木虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by zyj8119 at 2010-12-28 16:23:00:
[root@cluster SOURCE]# pgf90
-bash: pgf90: command not found
[root@cluster SOURCE]# pgif90
-bash: pgif90: command not found
[root@cluster SOURCE]# ./cpmd.x
./cpmd.x: error while loading shared ...

Makefile为：

[root@cluster SOURCE]# less Makefile
SHELL = /bin/sh
#
#--------------- Default Configuration for LINUX_IA64_INTEL-MPI ---------------
SRC  = .
DEST = .
BIN  = .
FFLAGS =
LFLAGS = -L/export/intel/mkl/lib/em64t -lmkl_intel_lp64 -lmkl_sequential -lmkl_c
ore -lpthread
CFLAGS = -D__alpha
CPP = /lib/cpp -P -C -traditional
CPPFLAGS = -D__alpha -DPOINTER8 -DFFT_DEFAULT -DALPHALINUX \
        -DMYRINET -DPARALLEL=parallel -DLINUX_IA64_INTEL -DINTEL_MKL
NOOPT_FLAG =
CC = mpicc -c -O
FC = mpif90 -c
LD = mpif90
AR = /usr/bin/ar -r
#----------------------------------------------------------------------------
#----------------------------------------------------------------------------
#----------------------------------------------------------------------------
# End of Personal Configuration
#----------------------------------------------------------------------------
CFGDEST = .
CFGMACH = LINUX_IA64_INTEL-MPI
CFGQMMM =
#
#  LIST OF FILES
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2楼2010-12-28 16:50:20
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valenhou001

至尊木虫 (职业作家)
★ ★ ★
ghcacj(金币+3):谢谢 2011-01-04 17:18:56
先通过locate libmkl_intel_lp64.a 或 locate libmkl_intel_lp64.so找到它们的绝对路径，即它们被放置的位置，然后将找个路径加到LD_LIBRARY的环境变量的附值中。
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3楼2011-01-01 10:59:48
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baoer3808

银虫 (小有名气)
★
ghcacj(金币+1): 谢谢 2011-03-29 12:40:11
改权限啊
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4楼2011-03-29 08:44:12
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xk6891

至尊木虫 (著名写手)
★ ★
ghcacj(金币+2): 谢谢 2011-04-01 12:30:07
[root@cluster SOURCE]# pgf90
-bash: pgf90: command not found
[root@cluster SOURCE]# pgif90
-bash: pgif90: command not found
f90没装好么？
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5楼2011-03-31 10:54:49
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xk6891

至尊木虫 (著名写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
可以尝试使用
#:ldd cpmd.x
查看一下哪些not found
找到缺失的库函数放进去～～okay
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6楼2012-02-24 11:08:52
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yoghurt117

木虫 (正式写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
mkl安装好以后你运行 source /opt/intel/mkl/bin/mklvars.sh 了么？
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7楼2012-03-22 11:54:15
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yoghurt117

木虫 (正式写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
找到你libmkl_intel_lp64.a文件的位置，然后用ln -s把它做个链接到/usr/lib64或/usr/lib下试试
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8楼2012-03-23 11:24:24
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