| 查看: 1319 | 回复: 5 | ||
| 【奖励】 本帖被评价5次，作者zhou2009增加金币 4.6 个 | ||
| 本帖产生 1 个 QC强帖 ，点击这里进行查看 | ||
[资源]
【zhou2009个人文集】关于Δρ计算的一些注意点
|
||
|
关于Δρ计算的一些注意点 一个虫友学作Δρ，选择了HCl来练手，结果作出来了，发现与文献上看到的大不一样，问我为什么。 因为不知道他是如何具体操作的，便拟写了几点让他对照自查，不想写下来还不少，虽然是简单一个HCl例子，但还是涉及到方方面面，麻雀虽小，肝胆具全！ 现贴在这里供学作Δρ虫友参考。 据我的经验基本原则是： 1、HCl、H、Cl的坐标都取HCl 中的，并用-1和nosymm将它们固定在某一个坐标平面。 2、对HCl、H、Cl统一自定义网格点数、网格的起始点和步长，不能让程序自选。 3、HCl分子取向的主轴是z还是x？Cl呢？指的是Cl的那个单电子轨道的取向要与HCl一致。Cl的那个单电子轨道的取向可以在multiwfn中看到，如果需要可以在这里可以改变取向。 深入的考虑是： 4、关于Cl的计算，如果用ROHF，单电子将放在孤对电子之上，是HOMO，能级比H还高。如果用HF计算，单电子将放在孤对电子之下，能级比H低得多。Cl用HF计算的总能量也比ROHF的低得多。故Cl应用HF计算的数据。 5、对于单原子Cl的计算，还不能加nosymm，因为加了，不作对称性操作，Cl的单电子取向不在某一个主轴方向，不能与HCl对应。这时是先算Cl不加nosymm，计算自动会将Cl放在坐标原点，单电子取向在主轴z方向。再安排HCl在主轴z方向，Cl放在坐标原点，并在输入坐标数据中在Cl和H之后加-1固定，并加nosymm以免改变了坐标系的主轴取向和挪动了电荷重心。 6、HCl的Δρ，既可作全电子的，又可以只作相关轨道的，如果只看成键，后者更明晰一些。因为HCl的成键，就只是Cl的那个单电子和H之间的，Cl上的其他电子没有参加与H的成键，MO的安排充分体现了这点。这时可取HCl的成键MO与Cl的那个单电子MO、H的即成。如果是作全电子的，Δρ还会包含Cl因吸引了电荷过来，使其上的孤对电子能级被抬升，也会反映到Δρ的图形上。 [ Last edited by yjcmwgk on 2011-2-10 at 10:45 ] |
回复此楼» 猜你喜欢
ELISA试验中不容忽视的细节盘点(二)
已经有0人回复
-
汕头大学化学招调剂，相关内容如下。
已经有4人回复
-
物理化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有211人回复
-
细胞培养，这22个细节一定要注意！（一）
已经有0人回复
-
已知面上挂了，小学校实验方向无平台，感觉太难了
已经有26人回复
-
CSC访学博后项目获批，外方学校暂停合作该怎么办？
已经有51人回复
-
求助各位大佬，球球了，在这科萨头
已经有0人回复
-
半透性容器进行高湿或者低湿研究
已经有0人回复
-
分子动力学模拟合作需求
已经有2人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 关于单点能计算的问题
已经有8人回复
- 关于用超胞方法计算声子的一些经验
已经有21人回复
- 【求助】用pwscf计算含有缺陷的表面，该注意什么
已经有3人回复
- 在网上求助计算化学问题时的注意事项-Sobereva
已经有6人回复
- 【求助】关于计算NICS（核独立化学位移）的一些疑问A
已经有3人回复
- 【求助】siesta 计算DOS应该注意什么问题
已经有3人回复
- 【求助】准确计算集居数应该注意什么？
已经有7人回复
- 【讨论】看文献应注意什么问题
已经有4人回复
- 【交流】关于撰写电化学论文-直接电化学中一些参量的计算问题
已经有21人回复
3楼2010-12-23 14:58:12
4楼2010-12-23 21:09:56
5楼2011-04-09 11:54:00
6楼2011-04-09 16:03:05
简单回复
qzhaosdu2楼
2010-12-23 13:03
回复
5