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[资源] 【zhou2009个人文集】关于Δρ计算的一些注意点

关于Δρ计算的一些注意点

一个虫友学作Δρ,选择了HCl来练手,结果作出来了,发现与文献上看到的大不一样,问我为什么。
因为不知道他是如何具体操作的,便拟写了几点让他对照自查,不想写下来还不少,虽然是简单一个HCl例子,但还是涉及到方方面面,麻雀虽小,肝胆具全!
现贴在这里供学作Δρ虫友参考。

据我的经验基本原则是:
1、HCl、H、Cl的坐标都取HCl 中的,并用-1和nosymm将它们固定在某一个坐标平面。
2、对HCl、H、Cl统一自定义网格点数、网格的起始点和步长,不能让程序自选。
3、HCl分子取向的主轴是z还是x?Cl呢?指的是Cl的那个单电子轨道的取向要与HCl一致。Cl的那个单电子轨道的取向可以在multiwfn中看到,如果需要可以在这里可以改变取向。
深入的考虑是:
4、关于Cl的计算,如果用ROHF,单电子将放在孤对电子之上,是HOMO,能级比H还高。如果用HF计算,单电子将放在孤对电子之下,能级比H低得多。Cl用HF计算的总能量也比ROHF的低得多。故Cl应用HF计算的数据。
5、对于单原子Cl的计算,还不能加nosymm,因为加了,不作对称性操作,Cl的单电子取向不在某一个主轴方向,不能与HCl对应。这时是先算Cl不加nosymm,计算自动会将Cl放在坐标原点,单电子取向在主轴z方向。再安排HCl在主轴z方向,Cl放在坐标原点,并在输入坐标数据中在Cl和H之后加-1固定,并加nosymm以免改变了坐标系的主轴取向和挪动了电荷重心。
6、HCl的Δρ,既可作全电子的,又可以只作相关轨道的,如果只看成键,后者更明晰一些。因为HCl的成键,就只是Cl的那个单电子和H之间的,Cl上的其他电子没有参加与H的成键,MO的安排充分体现了这点。这时可取HCl的成键MO与Cl的那个单电子MO、H的即成。如果是作全电子的,Δρ还会包含Cl因吸引了电荷过来,使其上的孤对电子能级被抬升,也会反映到Δρ的图形上。

[ Last edited by yjcmwgk on 2011-2-10 at 10:45 ]
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abbott

金虫 (著名写手)


★★★★★ 五星级,优秀推荐

太好了...
推荐....
3楼2010-12-23 14:58:12
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quantumor

金虫 (著名写手)


★★★★★ 五星级,优秀推荐

好文,学习了。
4楼2010-12-23 21:09:56
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boylc789

木虫 (著名写手)


★★★★★ 五星级,优秀推荐

好贴
5楼2011-04-09 11:54:00
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375642546

木虫 (正式写手)


★★★★★ 五星级,优秀推荐

顶帖儿~
6楼2011-04-09 16:03:05
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qzhaosdu2楼
2010-12-23 13:03   回复  
 
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