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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 【求助】计算吸附能有几点疑惑，请大家帮帮忙
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limin2007

铁杆木虫 (著名写手)

[交流] 【求助】计算吸附能有几点疑惑，请大家帮帮忙 已有6人参与

castep计算co原子在ZnO表面的吸附能。
我的方法是：E吸附能=E(co/ZnO）- E(ZnO) - E(co)
其中
E(co/ZnO）为单个co原子在ZnO表面吸附的优化构型的能量
E(ZnO) 为ZnO表面的优化构型的能量
E(co) 单个Pd原子的能量

初始原胞优化了，然后切割的ZnO表面，添加了真空层，固定下面几层原子，然上面原子层全部弛豫，计算得到的是E(ZnO)。我这样计算有没有问题？
我还有几个疑惑：
第一个问题：单个co原子放到弛豫后的ZnO表面上还是没有弛豫ZnO表面上？
第二个问题：计co原子能量的时候要和单个co原子放到ZnO表面上计算能量的参数一样吗？比如截断能和K点？看到论坛上说计算小分子的时候好像是说K点选择Gamma，但是我算单个co原子放到ZnO表面上的时候K点4*4*1？对于这个问题我该如何计算co分子的能量？
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1楼 2010-12-05 12:03:58
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hgye

金虫 (小有名气)
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sunyang1988(金币+2):谢谢交流 2010-12-05 14:40:05
第一个问题：吸附原子放在驰誉前和驰誉后的表面都可以，加了吸附原子后要重新进行驰誉。
第二个问题：计算单个吸附原子能量的参数不必完全和表面模型的参数保持一致，截断能还可以一致，K点不必一致，用Gamma就可以了，因为模型尺寸都不一样。
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2楼2010-12-05 13:59:31
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limin2007

铁杆木虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by hgye at 2010-12-05 13:59:31:
第一个问题：吸附原子放在驰誉前和驰誉后的表面都可以，加了吸附原子后要重新进行驰誉。
第二个问题：计算单个吸附原子能量的参数不必完全和表面模型的参数保持一致，截断能还可以一致，K点不必一致，用Gamma就可 ...

谢谢你帮我解决问题。
我还有个问题再请教。对于表面，我固定下面几层，选择分数坐标固定选项，后面的选择项都没有选择了。其余层都没有固定，全部弛豫了，我这样建立对不对？

我今天看了些相关的信息，看到有人说计算吸附的问题，只允许垂直于表面方向弛豫，而平行表面的方向不允许弛豫，这句话的意思是所有的层数都只是沿着垂直表面的方向弛豫吗？还是固定几层后，上面的几层只弛豫垂直于表面的方向？我不知道该如何理解这句话了。
对于计算吸附的问题，固定原子层的  弛豫的步骤是什么？谢谢你了。
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3楼2010-12-05 15:44:33
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hgye

金虫 (小有名气)
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zzy870720z(金币+1):谢谢交流 2010-12-06 13:49:27
你的做法是正确的。只允许垂直表面方向驰誉是不准确的，表面原子在平行于表面方向也可能会有移动。
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4楼2010-12-06 12:42:10
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yshl7237

铜虫 (小有名气)
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引用回帖:
Originally posted by limin2007 at 2010-12-05 12:03:58:
castep计算co原子在ZnO表面的吸附能。
我的方法是：E吸附能=E(co/ZnO）- E(ZnO) - E(co)
其中
E(co/ZnO）为单个co原子在ZnO表面吸附的优化构型的能量
E(ZnO) 为ZnO表面的优化构型的能量
E(co) 单个Pd原子的能 ...

你好，我想问一下您，在算E（co）时，是直接把一个co 放到晶胞内优化，然后算能量吗？
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前进！
5楼2011-04-16 15:33:27
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buct2010

金虫 (正式写手)
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mazuju028(金币+1): 谢谢交流 2011-04-16 17:34:51
引用回帖:
Originally posted by yshl7237 at 2011-04-16 15:33:27:
你好，我想问一下您，在算E（co）时，是直接把一个co 放到晶胞内优化，然后算能量吗？

是的，把CO放在一个真空盒子里（10*10埃的就行），然后优化，得到能量就是结合能E（CO）。
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6楼2011-04-16 16:45:05
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bubuweiying

金虫 (著名写手)
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引用回帖:
6楼: Originally posted by buct2010 at 2011-04-16 16:45:05:
是的，把CO放在一个真空盒子里（10*10埃的就行），然后优化，得到能量就是结合能E（CO）。

你好，请问结合能和吸附能有啥区别啊
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春天花会开！
7楼2011-08-27 11:04:39
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buct2010

金虫 (正式写手)
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引用回帖:
7楼: Originally posted by bubuweiying at 2011-08-27 11:04:39:
你好，请问结合能和吸附能有啥区别啊

呵呵，我看了一下，我的回帖有问题，E（CO）就是CO分子的能量不是结合能。结合能是C和O原子结合为CO释放的能量。吸附能是CO 吸附在体系表面所释放的能量。
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8楼2011-08-27 11:16:50
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bubuweiying

金虫 (著名写手)
引用回帖:
8楼: Originally posted by buct2010 at 2011-08-27 11:16:50:
呵呵，我看了一下，我的回帖有问题，E（CO）就是CO分子的能量不是结合能。结合能是C和O原子结合为CO释放的能量。吸附能是CO 吸附在体系表面所释放的能量。

谢谢啊
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春天花会开！
9楼2011-08-27 14:44:43
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buct2010

金虫 (正式写手)
引用回帖:
9楼: Originally posted by bubuweiying at 2011-08-27 14:44:43:
谢谢啊

呵呵，不客气
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10楼2011-08-27 15:21:45
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