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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 【求助】用Gaussview画分子轨道图和数据分析的结果不一致的问题
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crystal0714

金虫 (小有名气)

[交流] 【求助】用Gaussview画分子轨道图和数据分析的结果不一致的问题已有7人参与

我在用gaussian03里面的加电场计算Cu金属串配合物，采用B3LYP方法，混合基组，在加电场到0.015a.u.时，用Gaussview看优化后的LUMO分子轨道图时，轨道图显示的几乎没有电子云分布。
  然后，我就改变了下isovalue的值，从-0.01-0.01，就只有一些电子云分布在非金属外边。
  问题是，我在log文件中分析的各个原子对LUMO轨道的贡献，得出的结果是99%的贡献都是来自于金属，也就是说从数据分析的结论和分子轨道图形的结果不一致。而且，发现数据中的LUMO轨道主要分布在Cu的5s(3.95)、6s(6.92)、和11pz(5.08)上面。
请问大侠们，
（1）会不会是有电子分部在11pz这样太外层的轨道上而导致的分子轨道图几乎看不到什么电子云？
（2）能有什么办法能画出和数据一致的主要分布在金属上的分子轨道图吗？
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1楼2010-12-01 20:18:52
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qzhaosdu

金虫 (著名写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
11PZ?楼主你没看错吧？？
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Anewday,anewhour,anewminute,anewpeople.
2楼2010-12-01 21:26:11
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gengle

木虫 (著名写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
没遇到过，不清楚，顶起来学习
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3楼2010-12-01 23:48:29
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zhou2009

版主 (著名写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
我觉得，没有不一致的问题。

你用Gaussview看优化后的LUMO分子轨道图时，因为LUMO是空轨道，当然轨道图显示的几乎没有电子云分布。

当你分析各个原子对LUMO轨道的贡献，这时是设想这个空轨道如果有电子占据时当情形，如激发态，得出的结果是99%的贡献都是来自于金属，当然也是对的。

如果一定要看这个LUMO的电子云分布，可以将fch数据读入multiwfn，只对这个LUMO作电子密度cub文件，multiwfn可以显示它的三维图像。
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4楼2010-12-02 08:24:11
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liguanghua

铜虫 (正式写手)

兵部侍郎
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
您好！我想算分子轨道贡献。
In order to define the atoms which comprise a group, a file, gausssum2.1/groups.txt, should be created with a format similar to the following:
Ru
1
bpy1
2-11,14,17,22,27,34-35,42-43,50,57
bpy2
12,16,18-19,25-26,28-30,39-41,44-46,54-56,58,61
bpy3
13,15,20-21,23-24,31-33,36-38,47-49,51-53,59-60

如何按照这种格式写呢。没有看懂这种格式。请赐教！感激不尽！
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5楼2010-12-02 10:51:46
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Jasminer

铁杆木虫 (著名写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
我觉得你弄错了吧：GV看的是轨道图，不是电子云图，和有没有电子无关的。
感觉还是计算本身有问题，LUMO出现11pz……
引用回帖:
Originally posted by zhou2009 at 2010-12-02 08:24:11:
我觉得，没有不一致的问题。

你用Gaussview看优化后的LUMO分子轨道图时，因为LUMO是空轨道，当然轨道图显示的几乎没有电子云分布。

当你分析各个原子对LUMO轨道的贡献，这时是设想这个空轨道如果有电子占据 ...

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6楼2010-12-03 12:14:53
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crystal0714

金虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by qzhaosdu at 2010-12-01 21:26:11:
11PZ?楼主你没看错吧？？

没看错，这个11PZ是用Cu的SDD基组的输出文件的轨道系数那里得到的，我对应了下原子轨道那边，这几个轨道正确的说应该是6s（3.43）,8s (6.53),和7pz（ 4.46）。是很外层的轨道。。。
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7楼2010-12-06 08:23:53
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crystal0714

金虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by liguanghua at 2010-12-02 10:51:46:
您好！我想算分子轨道贡献。
In order to define the atoms which comprise a group, a file, gausssum2.1/groups.txt, should be created with a format similar to the following:
Ru
1
bpy1
2-11,14,17,2 ...

gausssum2.1/groups.txt？ 是什么东东？我算分子轨道贡献就是在输出文件当中查找“Molecular Orbital Coefficients”的那一部分，它输出的是所有分子轨道的每个原子轨道的系数，在这个基础上分析的。
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8楼2010-12-06 08:30:21
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huzijuan
9楼2014-10-19 12:24:14
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