| 查看: 545 | 回复: 0 | |||
[交流]
【求助】请教有关TK模型模拟蛋白质静电作用的问题
|
|
我是一位来自ECUST的硕士研究生，专业主攻研究在溶液中的蛋白质的静电效应，由于理论基础和研究方法的缺陷，碰到一些问题感到难以解决。想在这向各位大虾们请教几个有关蛋白质内部静电作用模拟的问题。 我主要是在尝试使用TK模型（Tanford-kirkwood model）来模拟蛋白质的静电作用时出现了理解上的难题：从我的理解，在对蛋白质的静电作用的模拟计算中，经历了波恩模型——TK模型——PB方程（利用有限元差分来求解）这一大致的研究历程。波恩模型和TK模型均将蛋白质处理成一个均匀介质的疏水球形。我也想利用TK模型来展开对蛋白质内部电荷-电荷相互作用的计算。但是怎样在这一球形定位氨基酸呢？在Tanford和kirkwood于1957年写的提出该模型的文献中我并没有找到答案。 图一：TK模型图示：  如图一：如何定位qi和qj？又如何确定两个电荷之间的夹角？因为在计算中这些参数是必须的。 另外，在其他一些综述中，又提到TKmodel将电荷排布在蛋白的表面，这是否又互相矛盾了呢？ 以上这些问题一直困扰了我很久，相信在理论上这些肯定有很多错误。哪里理解错了，需要在哪些地方注意，希望各位同学多多指出，先谢谢大家了 |
回复此楼» 猜你喜欢
请问四氢呋喃溶解的聚合物用甲醇沉淀时，如何使沉淀过程加速？
已经有2人回复
-
半透性容器进行高湿或者低湿研究
已经有0人回复
-
物理化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有127人回复
-
伦敦大学学院Benjamin Moss博士招收人工智能、原位光谱、催化相关26年博士生
已经有11人回复
-
Chemical Bonding at Surfaces and Interfaces,最经典的一本表面上化学相互作用教材
已经有0人回复
-
中国科学院成都山地灾害与环境研究所2026年特别研究助理（博士后）招聘启事
已经有0人回复
-
诚邀有志之士加入江苏大学环境学院合成生物学课题组！(长期接收学硕专硕、硕博连读)
已经有16人回复
-
一志愿南大理论与计算化学方向（070300）342分，求调剂
已经有1人回复
-
欢迎化学、化工、物理、材料、或计算机背景的考研咨询
已经有0人回复
-
调剂招生
已经有7人回复
-
河南理工大学化工学院招收调剂生啦！
已经有1人回复
10