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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » 其他 » 【讨论】软件怎样范德瓦尔斯半径
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yufengjiayou

木虫 (小有名气)

[交流] 【讨论】软件怎样范德瓦尔斯半径

MS软件怎样计算小分子和离子（如氯离子，水和氢离子等）的范德瓦尔斯半径
  欢迎高手们指教……

[ Last edited by yufengjiayou on 2010-11-14 at 10:22 ]
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1楼 2010-11-14 09:19:19
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yufengjiayou

木虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by qzhaosdu at 2010-11-16 13:36:52:
van der Waals半径文献上都有数值，每个人计算的都不同。

O(∩_∩)O谢谢你的回答
我还要请教一下:水分子这些常见小分子的vdW半径文献上有，但是很多其他离子的半径文献上没有实验数据，请问较为准确的计算方法用软件怎样算，请不吝赐教……
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5楼2010-11-16 14:49:45
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yufengjiayou

木虫 (小有名气)
高手们指教一下啊！
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3楼2010-11-16 10:47:25
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qzhaosdu

金虫 (著名写手)
★ ★ ★
ghcacj(金币+2):谢谢 2010-11-16 13:56:11
yufengjiayou(金币+2): 2010-11-16 14:53:26
zh1987hs(金币+1):谢谢 2010-11-16 16:26:46
van der Waals半径文献上都有数值，每个人计算的都不同。
赞一下(2人) 回复此楼
4楼2010-11-16 12:36:52
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qzhaosdu

金虫 (著名写手)
★ ★ ★
yufengjiayou(金币+3):呵呵，谢谢你继续回帖…… 2010-11-16 17:19:15
ghcacj(金币+3):谢谢 2010-11-17 13:07:25
引用回帖:
Originally posted by yufengjiayou at 2010-11-16 14:49:45:

O(∩_∩)O谢谢你的回答
我还要请教一下:水分子这些常见小分子的vdW半径文献上有，但是很多其他离子的半径文献上没有实验数据，请问较为准确的计算方法用软件怎样算，请不吝赐教……

这个，我不是很了解，不过你如果是想知道一个分子的半径的话，可以这样算。
Gaussian里有个关键词是Volume,是算分子体积的。你可以先算算分子的体积。
如果你这个分子的大部分能用个球包起来的话，那么V=4/3*PI*R3,这个R就是你要的半径了。但是说实话，这样算对一些规则的有对称性的分子还有点意义，对一般的分子没意思。
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6楼2010-11-16 16:49:45
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