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y851012172金虫 (正式写手)
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SCORPIO (Structure/Calorimetry of Reported Interactions Online) (29) is very similar in concept to the PDBcal database, although slightly more limited in scope with around 30 different proteins and more than 250 distinct protein–small molecule complexes. The small molecules comprise both natural ligands and synthetic compounds. As observed in the PDBcal database, only a small percentage of entries (15%) include measurements of the binding heat capacity. As the authors state, this shortfall is understandable given the extra effort required for such measurements, but regrettable because this parameter is strongly correlated to the extent and nature of binding interfaces and is thus a rich source of information. It can only be encouraged that future experimenters consider performing such measure- ments wherever possible. The authors have presented an extensive statistical analysis of the curated structure–ITC data. 前辈帮忙,谢谢! |
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tjj968
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【答案】应助回帖
y851012172(金币+2, 翻译EPI+1): 2010-11-05 12:03:26
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SCORPIO(量热结构在线交互报道)虽然略微限制于大约30种不同的蛋白质和250多个小分子特异混合蛋白,但与PDBcal数据库在概念上非常相似。小分子由自然配体合成化合物组成。正如在PDBcal数据库中观察的那样,只有一小部分项目(15%)包括对结合热容量的测量。如作者所述,这需要额外的努力来测量,这种不足是可以接受的,但遗憾的是,这个参数与绑定接口的性质和内容密切相关,所以它是一个丰富信息的来源,只能鼓励以后的实验者们尽可能的考虑进行这种测量。作者提出了关于策划结构的广泛数据分析———ITC数据。 (希望能对i你有所帮助) |

2楼2010-11-05 11:29:16












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