24小时热门版块排行榜    

查看: 651  |  回复: 2

zky322003

铜虫 (小有名气)

[交流] 【求助】富勒烯化合物在GV中Z-matrix如何保存呢!请大侠点拨

我遇到一个问题,我想在富勒烯优化好的结构上做一个San 势能面扫面,但是利用GV保存的时候,我也用GV中保存Z-matrix的试了,结果保存成如下图了,同样的我用苯做了实验,就会存成Z-matrix。


像富勒烯这类Z-matrix格式的坐标,怎么做SCAN呢!


[ Last edited by zky322003 on 2010-11-1 at 15:36 ]
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hzfish

金虫 (正式写手)

★ ★
zhou2009(金币+2): 2010-11-02 09:29:52
另存为就可以,Save As改Gaussian Input File,不要用Write Cartesians。

%chk=D:\c60\jobs\11.chk
# hf/3-21g geom=connectivity

Title Card Required

0 1
C              
C                  1            B1
C                  2            B2    1            A1
C                  3            B3    2            A2    1            D1    0
C                  4            B4    3            A3    2            D2    0
C                  1            B5    2            A4    3            D3    0
C                  1            B6    6            A5    5            D4    0
C                  7            B7    1            A6    6            D5    0
C                  2            B8    1            A7    6            D6    0
C                  9            B9    2            A8    1            D7    0
C                  3           B10    2            A9    1            D8    0
C                  4           B11    3           A10    2            D9    0
C                 12           B12    4           A11    3           D10    0
C                 13           B13   12           A12    4           D11    0
C                 14           B14   13           A13   12           D12    0
C                 15           B15   14           A14   13           D13    0
C                 16           B16   15           A15   14           D14    0
C                 17           B17   16           A16   15           D15    0
C                  7           B18    1           A17    6           D16    0
C                  8           B19    7           A18    1           D17    0
C                 20           B20    8           A19    7           D18    0
C                 21           B21   20           A20    8           D19    0
C                 22           B22   21           A21   20           D20    0
C                 18           B23   17           A22   16           D21    0
C                 24           B24   18           A23   17           D22    0
C                 16           B25   15           A24   14           D23    0
C                 26           B26   16           A25   15           D24    0
C                 27           B27   26           A26   16           D25    0
C                 12           B28    4           A27    3           D26    0
C                 28           B29   27           A28   26           D27    0
C                 30           B30   28           A29   27           D28    0
C                 31           B31   30           A30   28           D29    0
C                 32           B32   31           A31   30           D30    0
C                 33           B33   32           A32   31           D31    0
C                 30           B34   28           A33   27           D32    0
C                 35           B35   30           A34   28           D33    0
C                 36           B36   35           A35   30           D34    0
C                 37           B37   36           A36   35           D35    0
C                 13           B38   12           A37    4           D36    0
C                 39           B39   13           A38   12           D37    0
C                 32           B40   31           A39   30           D38    0
C                 41           B41   32           A40   31           D39    0
C                 42           B42   41           A41   32           D40    0
C                 43           B43   42           A42   41           D41    0
C                 44           B44   43           A43   42           D42    0
C                 45           B45   44           A44   43           D43    0
C                 46           B46   45           A45   44           D44    0
C                 35           B47   30           A46   28           D45    0
C                 36           B48   35           A47   30           D46    0
C                 49           B49   36           A48   35           D47    0
C                 50           B50   49           A49   36           D48    0
C                 23           B51   22           A50   21           D49    0
C                 47           B52   46           A51   45           D50    0
C                 53           B53   47           A52   46           D51    0
C                 45           B54   44           A53   43           D52    0
C                 55           B55   45           A54   44           D53    0
C                 56           B56   55           A55   45           D54    0
C                 29           B57   12           A56    4           D55    0
C                 11           B58    3           A57    2           D56    0
C                 34           B59   33           A58   32           D57    0

   B1             1.46388900
   B2             1.38468043
   B3             1.46390163
   B4             1.38466800
   B5             1.38466518
   B6             1.46389963
   B7             1.46387176
   B8             1.46389387
   B9             1.38466058
   B10            1.46388690
   B11            1.46389183
   B12            1.38468789
   B13            1.46389300
   B14            1.38466908
   B15            1.46390160
   B16            1.46388332
   B17            1.38467113
   B18            1.38467232
   B19            1.38466513
   B20            1.46386610
   B21            1.38467254
   B22            1.46389989
   B23            1.46387993
   B24            1.38467384
   B25            1.38466966
   B26            1.46390957
   B27            1.38467196
   B28            1.46386310
   B29            3.70469184
   B30            1.38466384
   B31            1.46389107
   B32            1.38467824
   B33            1.46387402
   B34            2.36862863
   B35            1.46390083
   B36            1.46388864
   B37            1.38466450
   B38            1.46385986
   B39            1.38467458
   B40            1.46387703
   B41            1.38465197
   B42            1.46391343
   B43            1.38467893
   B44            1.46386858
   B45            1.46388064
   B46            1.38467000
   B47            1.38466105
   B48            1.38467993
   B49            1.46389045
   B50            1.38466960
   B51            1.38466728
   B52            1.46388756
   B53            1.38466602
   B54            1.38468285
   B55            1.46385664
   B56            1.38467344
   B57            1.38467766
   B58            1.38466222
   B59            1.38467580
   A1           119.99755292
   A2           120.00103780
   A3           120.00008514
   A4           120.00216978
   A5           119.99976198
   A6           108.00032427
   A7           108.00036688
   A8           120.00065580
   A9           119.99729348
   A10          108.00006153
   A11          119.99988597
   A12          120.00074171
   A13          119.99880523
   A14          119.99901844
   A15          108.00006273
   A16          120.00035005
   A17          120.00004116
   A18          119.99955393
   A19          120.00068321
   A20          119.99980389
   A21          120.00079567
   A22          120.00025017
   A23          119.99971622
   A24          120.00041355
   A25          120.00007061
   A26          120.00013584
   A27          108.00072895
   A28           97.63183944
   A29           97.63317855
   A30          120.00001200
   A31          119.99897243
   A32          120.00056476
   A33           82.36857797
   A34           72.00040943
   A35          108.00016971
   A36          120.00038290
   A37          119.99921411
   A38          120.00067979
   A39          108.00034645
   A40          120.00128859
   A41          119.99986636
   A42          119.99890693
   A43          119.99994025
   A44          108.00022914
   A45          120.00074933
   A46          143.99903235
   A47          120.00016075
   A48          119.99947864
   A49          120.00023730
   A50          119.99964265
   A51          119.99969803
   A52          119.99971281
   A53          119.99929394
   A54          119.99988028
   A55          120.00050044
   A56          119.99957275
   A57          120.00127451
   A58          119.99979204
   D1            -0.00085869
   D2             0.00200543
   D3            -0.00100340
   D4          -138.19167217
   D5           142.62446622
   D6          -142.62315693
   D7           142.61902997
   D8          -138.18656512
   D9          -142.61898728
   D10          142.62373738
   D11           -0.00094955
   D12            0.00000000
   D13         -138.18955458
   D14          142.62204155
   D15         -142.62359554
   D16            0.00046493
   D17         -142.62266058
   D18           -0.00039035
   D19            0.00032923
   D20          138.18993510
   D21            0.00127188
   D22           -0.00079240
   D23           -0.00050301
   D24            0.00000000
   D25            0.00000000
   D26            0.00000000
   D27          124.88051671
   D28         -143.66763807
   D29          124.88166609
   D30            0.00275534
   D31           -0.00066451
   D32            0.00140999
   D33           24.06917616
   D34            0.00071918
   D35         -142.62261755
   D36         -138.19197485
   D37            0.00079885
   D38         -142.61958486
   D39          142.62312623
   D40           -0.00196084
   D41            0.00155013
   D42         -138.19167863
   D43          142.62223648
   D44         -142.62081523
   D45          -92.49628754
   D46         -142.62214884
   D47            0.00091850
   D48           -0.00112727
   D49           -0.00124763
   D50           -0.00146464
   D51            0.00084089
   D52            0.00000000
   D53            0.00000000
   D54            0.00000000
   D55          142.62402126
   D56           -0.00148982
   D57           -0.00112191

1 2 1.0 6 2.0 7 1.0
2 3 2.0 9 1.0
3 4 1.0 11 1.0
4 5 2.0 12 1.0
5 6 1.0 15 1.0
6 17 1.0
7 8 1.0 19 2.0
8 9 1.0 20 2.0
9 10 2.0
10 57 1.0 59 1.0
11 29 1.0 59 2.0
12 13 2.0 29 1.0
13 14 1.0 39 1.0
14 15 2.0 28 1.0
15 16 1.0
16 17 1.0 26 2.0
17 18 2.0
18 19 1.0 24 1.0
19 22 1.0
20 21 1.0 56 1.0
21 22 2.0 54 1.0
22 23 1.0
23 24 1.0 52 2.0
24 25 2.0
25 26 1.0 50 1.0
26 27 1.0
27 28 2.0 49 1.0
28 38 1.0
29 58 2.0
30 31 2.0 37 1.0 60 1.0
31 32 1.0 40 1.0
32 33 2.0 41 1.0
33 34 1.0 44 1.0
34 46 1.0 60 2.0
35 36 1.0 48 2.0 60 1.0
36 37 1.0 49 2.0
37 38 2.0
38 39 1.0
39 40 2.0
40 58 1.0
41 42 2.0 58 1.0
42 43 1.0 59 1.0
43 44 2.0 57 1.0
44 45 1.0
45 46 1.0 55 2.0
46 47 2.0
47 48 1.0 53 1.0
48 51 1.0
49 50 1.0
50 51 2.0
51 52 1.0
52 53 1.0
53 54 2.0
54 55 1.0
55 56 1.0
56 57 2.0
57
58
59
60
2楼2010-11-02 09:20:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zky322003

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by hzfish at 2010-11-02 09:20:57:
另存为就可以,Save As改Gaussian Input File,不要用Write Cartesians。

%chk=D:\c60\jobs\11.chk
# hf/3-21g geom=connectivity

Title Card Required

0 1
C              
C                  1  ...

对我的化合物来说还是不好用啊!
3楼2010-11-02 13:16:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 zky322003 的主题更新
普通表情 高级回复(可上传附件)
信息提示
请填处理意见