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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Monte Carlo » 【求助】MS中小分子在沸石中擴散之設定
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zyj8119

木虫 (著名写手)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
zh1987hs(金币+1):谢谢 2010-11-23 12:43:58
引用回帖:
Originally posted by alphawei at 2010-11-22 21:51:57:
對於ZEOLITE中水分子擴散，有一篇提到沸石結構模型採用全剛性，半剛性及全柔性三種，對水的擴散之MSD影響挺大，約略差了3-4倍，但是不知在MS中如何設定？

MS的骨架都是刚性的，没有柔性的，你看到的那篇文章，可能是用towhee做的。貌似我就只记得只有towhee能允许骨架是柔性的。。。
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好好学习，天天向上。
11楼2010-11-22 21:57:28
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043114076

木虫 (正式写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by alphawei at 2010-11-22 21:51:57:
對於ZEOLITE中水分子擴散，有一篇提到沸石結構模型採用全剛性，半剛性及全柔性三種，對水的擴散之MSD影響挺大，約略差了3-4倍，但是不知在MS中如何設定？

能不能告诉是哪篇文献？我很感兴趣它用的是什么力场
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12楼2010-11-23 08:19:50
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ghcacj

荣誉版主 (著名写手)

阿超

优秀版主
★ ★
zh1987hs(金币+2):鼓励交流 2010-11-23 12:43:42
引用回帖:
Originally posted by zyj8119 at 2010-11-22 21:57:28:

MS的骨架都是刚性的，没有柔性的，你看到的那篇文章，可能是用towhee做的。貌似我就只记得只有towhee能允许骨架是柔性的。。。

towhee不能算MD吧，我觉得只要是编程的程序，给定骨架原子之间力的参数，比如键伸缩，键角变化等参数，应该就可以计算柔性结构。
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13楼2010-11-23 09:22:20
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alphawei

金虫 (小有名气)
★ ★
zh1987hs(金币+2):谢谢 2010-11-23 12:43:22
引用回帖:
Originally posted by 043114076 at 2010-11-23 08:19:50:


能不能告诉是哪篇文献？我很感兴趣它用的是什么力场

Jain Yang Wu et.al,, "molecular simulation of water/alcohol mixtures' adsorption and diffusion in zeolite 4A membrane" J.Phys.Chem.B 113,4267-4274(2009)

力場採用COMPASS
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14楼2010-11-23 12:06:33
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043114076

木虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by alphawei at 2010-11-23 12:06:33:


Jain Yang Wu et.al,, "molecular simulation of water/alcohol mixtures' adsorption and diffusion in zeolite 4A membrane" J.Phys.Chem.B 113,4267-4274(2009)

力場採用COMPASS

谢谢
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15楼2010-11-23 14:49:56
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lanyaqian

木虫 (正式写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
Originally posted by ghcacj at 2010-10-27 13:21:52:
扩散的话应该先做吸附吧，用Sorption中的Fixed loading把一定量的水分子吸附在LTA结构中，然后再做MD计算，就可以了。

经常看到您的帖子  我是做实验的 做mof  一直想学monte carlo来计算吸附  是不是很难学 能不能和你合作 或者是 你知道国内那个课题组做的比较好 我的email lanyq176@nenu.edu.cn  谢谢
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16楼2011-06-11 00:29:02
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charmingzhu

银虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
楼主，请教一个问题，我的MS为5.0的。Modules中的Sorption为什么木有FIXED LOADING，而只有Calculation和Save Settings这两个选项？
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我是来学习的。
17楼2012-05-31 20:50:57
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