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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » 【原创】关于结构弛豫设置及收敛判据选择的一点体会
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cenwanglai

荣誉版主 (知名作家)
★
youzhizhe(金币+1):谢谢交流。 2011-01-02 19:35:45
引用回帖:
Originally posted by 江山2010 at 2010-11-24 17:14:22:

高手你好，我在看了你的心得后又问了我的老板一些相关的问题，其中有一个地方和你说的有一些矛盾，在进行结构驰豫的时候你是先将POTIM设置为默认值，再将potim设置为较小的值，但是我的老师说先设为较小的值，再 ...

我也称不上高手，呵呵。

可能你们老板说的是对的。我这个没有理论依据。
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51楼2010-11-24 20:37:22
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piaoxue001

木虫 (正式写手)
楼主您好！
关于“这个时候，是不是该怀疑对超胞仅做Gamma点结构优化的合理性呢？是不是要提高K点密度再做结构优化呢？”  请问团簇分子的优化用G点优化还需要增大K点吗？ 有人说必须保证K点是G点，但我没想明白？
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52楼2010-11-25 13:20:08
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cenwanglai

荣誉版主 (知名作家)
★
youzhizhe(金币+1):谢谢交流。 2011-01-02 19:35:58
引用回帖:
Originally posted by piaoxue001 at 2010-11-25 13:20:08:
楼主您好！
关于“这个时候，是不是该怀疑对超胞仅做Gamma点结构优化的合理性呢？是不是要提高K点密度再做结构优化呢？”  请问团簇分子的优化用G点优化还需要增大K点吗？ 有人说必须保证K点是G点，但我没想明白？

G点是对称性最高的点，简并度最高（这个，我不是很确定呢，呵呵），因而取一个K点的时候，就取Gamma点最具代表性。而且取Gamma点，程序计算速度最快。

对于分子，团簇等本身就是非周期性结构，一般都是推荐用单K点优化。这源于其物理意义。但是在用周期性结构来模拟分子和团簇的时候，我不敢说不用加密K点。
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53楼2010-11-25 13:41:20
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piaoxue001

木虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by cenwanglai at 2010-11-25 13:41:20:


G点是对称性最高的点，简并度最高（这个，我不是很确定呢，呵呵），因而取一个K点的时候，就取Gamma点最具代表性。而且取Gamma点，程序计算速度最快。

对于分子，团簇等本身就是非周期性结构，一般都是推荐 ...

非常感谢您的解释   是不是要做个测试-- 用优化好的团簇结构，增大K点在计算。比较一下呢？  关于这一点，我以前测试过一个Au在10*10*10的晶胞中算的态密度和增大k点后算的态密度，结果是G点的合理，不知道我的测试是否有普遍意义
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54楼2010-11-25 15:24:16
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cenwanglai

荣誉版主 (知名作家)
★ ★
youzhizhe(金币+1):呵呵 感恩节的末尾祝你快乐 2010-11-25 23:51:55
youzhizhe(金币+1):鼓励交流。 2011-01-02 19:36:10
引用回帖:
Originally posted by piaoxue001 at 2010-11-25 15:24:16:

非常感谢您的解释   是不是要做个测试-- 用优化好的团簇结构，增大K点在计算。比较一下呢？  关于这一点，我以前测试过一个Au在10*10*10的晶胞中算的态密度和增大k点后算的态密度，结果是G点的合理，不知道我的 ...

这个我也不清楚。呵呵，往后的问题只有等你我成为高手，或者等待高手来解答了。
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55楼2010-11-25 15:55:00
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black_leopard

银虫 (初入文坛)
好贴。。。。谢谢分享
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56楼2010-11-28 20:08:45
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zsjan

金虫 (正式写手)
这个多次提到分步优化的问题，但是一次优化和分步优化的结果有时候是不同，这个问题该怎么解释呢？http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=2627893&fpage=1这个帖子的讨论就是这个问题……

[ Last edited by zsjan on 2010-11-29 at 13:25 ]
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57楼2010-11-29 13:01:07
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cenwanglai

荣誉版主 (知名作家)
★
youzhizhe(金币+1):鼓励交流。 2011-01-02 19:36:24
引用回帖:
Originally posted by zsjan at 2010-11-29 13:01:07:
这个多次提到分步优化的问题，但是一次优化和分步优化的结果有时候是不同，这个问题该怎么解释呢？http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=2637008&fpage=1这个帖子的讨论就是这个问题……

是可能有不同。按照第一性原理的原则来将，差别应该很小很小。如果不是很小，那可能是找到不同的“基态”了。
另外，多步优化是没有办法的办法。不是必须的。特别是针对起始结构不太合理的场合。这样开始的粗略优化可以尽快发现问题，尽快做出修正。
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58楼2010-11-29 13:17:35
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拓海1627

金虫 (正式写手)

★★★★★ 五星级,优秀推荐

楼主强人

请教个问题：对于掺杂体系，金属的，POSCAR 直接COPY美国海军实验室晶体结构信息可行？
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59楼2010-11-30 15:04:07
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cenwanglai

荣誉版主 (知名作家)
★ ★
youzhizhe(金币+2):鼓励交流。 2011-01-02 19:36:46
引用回帖:
Originally posted by 拓海1627 at 2010-11-30 15:04:07:
楼主强人

请教个问题：对于掺杂体系，金属的，POSCAR 直接COPY美国海军实验室晶体结构信息可行？

一般来说都需要自己再优化一下。

为后续计算考虑，“输入”还是要在自己“可控”的范围。

也有人直接用别人的结构算的。
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60楼2010-11-30 15:11:06
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gleerat

木虫 (正式写手)

★★★★★ 五星级,优秀推荐

很重要的话题，之前收藏过，现在再次标记。
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61楼2010-11-30 19:44:19
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匿名


本帖仅楼主可见
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62楼2010-12-30 15:21:40
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llg1987

金虫 (知名作家)

★★★★★ 五星级,优秀推荐

很好的总结，新手来顶
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63楼2011-01-03 14:51:07
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enola

捐助贵宾 (正式写手)

★★★★★ 五星级,优秀推荐

感谢楼主的经验。。。。
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64楼2011-01-04 12:05:04
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joannewanghf

铁虫 (小有名气)
难得的好帖。
讲解很细致，语言规范又流畅，可见楼主功力之深厚！
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65楼2011-01-04 19:28:16
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cenwanglai

荣誉版主 (知名作家)
引用回帖:
Originally posted by joannewanghf at 2011-01-04 19:28:16:
难得的好帖。
讲解很细致，语言规范又流畅，可见楼主功力之深厚！

真的？那我要好好照照镜子，呵呵。
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66楼2011-01-05 09:47:10
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15093657516

银虫 (初入文坛)

好东西

好东西，楼主辛苦了
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67楼2011-01-06 15:30:22
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joannewanghf

铁虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by cenwanglai at 2011-01-05 09:47:10:


真的？那我要好好照照镜子，呵呵。

呵呵 我是说真的呢。我也是做理论催化的～
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68楼2011-01-06 17:15:36
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hn19870519

木虫 (正式写手)

★★★★★ 五星级,优秀推荐

很好的资料啊！！！强烈顶起
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69楼2011-01-12 15:57:02
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hookah

木虫 (正式写手)

★★★★★ 五星级,优秀推荐

非常好饿实战经验，谢谢楼主！
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70楼2011-01-24 22:05:06
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yc258258

木虫 (正式写手)
好帖，必回
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71楼2011-02-11 18:59:57
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lfzlpd

铜虫 (小有名气)

★★★★★ 五星级,优秀推荐

好贴，我只有慢慢领悟了
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72楼2011-02-14 11:18:51
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cenwanglai

荣誉版主 (知名作家)
补充了MAXMIX，这个，好像比较牛，没试过。
分子动力学作为初始结构不太好的结构预优化，也是很好的办法，但是我还没学会。看谁能补充。
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74楼2011-02-25 09:52:36
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fzuvivi

金虫 (小有名气)

★★★★★ 五星级,优秀推荐

引用回帖:
Originally posted by cenwanglai at 2011-02-25 09:52:36:
补充了MAXMIX，这个，好像比较牛，没试过。
分子动力学作为初始结构不太好的结构预优化，也是很好的办法，但是我还没学会。看谁能补充。

搭贴请教楼主，对于简单六方晶系，如何去优化晶格常数a,c呢？

是先固定c/a值，然后取一系列的a值优化，得到E-V关系曲线，拟合得到平衡体积后，计算得到平衡常数a0；然后，固定平衡常数a0，做一系列的c/a优化，同样得到E-V关系曲线，拟合得到平衡的c/a值，最后，确定a和c？？？

先谢谢楼主帮忙答疑解惑～
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75楼2011-04-01 09:56:31
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cenwanglai

荣誉版主 (知名作家)
自己顶一下，更新到第四条。
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76楼2011-04-01 12:42:48
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JiDP

金虫 (初入文坛)

★★★★★ 五星级,优秀推荐

谢谢
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77楼2011-04-01 14:55:30
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chenyuchen

木虫 (正式写手)

★★★★★ 五星级,优秀推荐

结构优化问题确实很多，要积累经验啊！
多谢楼主分享经验！
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78楼2011-04-17 21:43:09
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haowenping

木虫 (著名写手)

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引用回帖:
Originally posted by cenwanglai at 2010-10-21 14:07:03:
呵呵，

初略计算(示意设置，请勿复制)：

ISTART =0; ICHARG =2;EDIFF=1E-3;EDIFFG=-0.2,ISPIN=1;NSW=40

再计算（示意设置，请勿复制）：
cp CONTCAR POSCAR
ISTART =1;ICHARG=1;EDIFF=1E-4;EDIF ...

谢谢你的心得，我想问下，我也出现过弛豫很难收敛的情况。根据你分享的这个心得，是不是先做一次较为粗糙的收敛，也就是说设置的参数精度较低，比如说像你设置的那样，EDIFF=1E-3;EDIFFG=-0.2，然后在它收敛后，再把弛豫后的CONTCAR复制成为POSCAR，然后所要设置的参数就是提高精度，还有ISTART=1，ICHARG=2，是这样的吗？
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79楼2011-04-18 09:26:46
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cocolv

木虫 (正式写手)

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谢谢谢谢！！
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80楼2011-04-18 09:51:29
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cenwanglai

荣誉版主 (知名作家)
引用回帖:
Originally posted by haowenping at 2011-04-18 09:26:46:
谢谢你的心得，我想问下，我也出现过弛豫很难收敛的情况。根据你分享的这个心得，是不是先做一次较为粗糙的收敛，也就是说设置的参数精度较低，比如说像你设置的那样，EDIFF=1E-3;EDIFFG=-0.2，然后在它收敛后 ...

重新计算的时候ICHARG = 2.其他可以。
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81楼2011-04-18 10:28:04
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onexf766

木虫 (正式写手)

★★★★★ 五星级,优秀推荐

pretty good!
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83楼2011-04-27 13:32:43
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youzhizhe

荣誉版主 (职业作家)

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谢谢最近更新。
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84楼2011-04-27 17:17:03
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donggaomin

金虫 (正式写手)

★★★★★ 五星级,优秀推荐

好帖！
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85楼2011-05-27 09:47:33
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bird007

荣誉版主 (职业作家)
帖子真精彩!
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86楼2011-08-31 07:31:29
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aylayl08

荣誉版主 (文坛精英)
帖子真精彩!
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87楼2011-08-31 07:40:16
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lushunqi

禁虫 (小有名气)
本帖内容被屏蔽
88楼2011-08-31 15:02:22
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后天一

木虫 (小有名气)
帖子真精彩!
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89楼2011-08-31 15:07:15
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Gina88

木虫 (正式写手)

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youshouhuo
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90楼2011-09-01 11:24:24
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huyuxiav

金虫 (初入文坛)

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学习了
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91楼2011-09-15 22:27:04
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kmw.8668

金虫 (正式写手)

★★★★★ 五星级,优秀推荐

非常好的帖子！谢谢楼主！
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92楼2011-11-30 10:12:04
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cenwanglai

荣誉版主 (知名作家)
引用回帖:
92楼: Originally posted by kmw.8668 at 2011-11-30 10:12:04:
非常好的帖子！谢谢楼主！

>xdat2xyz XDATCAR

!上面这个命令生成movie.xyz

>xcrysden --xyz movie.xyz

上面这个命令图形化打开movie.xyz
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93楼2011-11-30 10:50:04
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kmw.8668

金虫 (正式写手)
引用回帖:
93楼: Originally posted by cenwanglai at 2011-11-30 10:50:04:
>xdat2xyz XDATCAR

!上面这个命令生成movie.xyz

>xcrysden --xyz movie.xyz

上面这个命令图形化打开movie.xyz

不知道为什麽，我的xcrysden下没有你说的xdat2xyz 这个命令，XDATCAR这个文件里的内容主要是作什麽的呀？你有时间再回复我吧。
赞一下 回复此楼
94楼2011-11-30 16:14:52
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cenwanglai

荣誉版主 (知名作家)
引用回帖:
94楼: Originally posted by kmw.8668 at 2011-11-30 16:14:52:
不知道为什麽，我的xcrysden下没有你说的xdat2xyz 这个命令，XDATCAR这个文件里的内容主要是作什麽的呀？你有时间再回复我吧。

xdat2xyz 不是xcrysden的命令。

这个是vtstool code中的命令。去这里下载下来：http://theory.cm.utexas.edu/vtsttools/
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95楼2011-11-30 16:28:48
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jphuang_63

至尊木虫 (正式写手)

★★★ 三星级,支持鼓励

讲得很好，但不知这种方法是否可以用到MS上？
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96楼2011-12-22 18:36:53
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dwd0826

铁杆木虫 (著名写手)

★★★★★ 五星级,优秀推荐

mark
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97楼2011-12-26 11:46:21
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liuqun

木虫 (小有名气)

★★★★★ 五星级,优秀推荐

楼主强人
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98楼2012-02-25 12:44:58
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简单回复
sg1840892673楼
2011-02-14 11:39   回复  
五星好评  
phys82楼
2011-04-27 10:09   回复  
五星好评  支持
songbone99楼
2012-03-26 13:36   回复  
五星好评  
154552485100楼
2012-05-02 09:27   回复  
五星好评  
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