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小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
lstt09nk(金币+5):很好，很详细 2010-10-20 09:19:46
建议搂主，回头好好的补一补 生物信息学，不管你作为不作为你的主打方向，都是有好处的：
生物信息学，是一个很系统的东西，也是一个很有用的东西。除了每天去genbank，意外你还要多事情要做：
我只给你举些常见的例子：
模型分析型：好多国内外优秀生物学服务器，都是基于自己的一个模型（可能是一个很小的SCI paper）发展成为学界大牛 （PFAM: http://pfam.sanger.ac.uk/search. 模型：hidden Markov models （HMMs））通过对部分一致基因的分析，就能拿到保守位点，从而对未知基因进行功能预测: 尤其是基因家族。其他的保守位点分析如：MEME,
大小通吃型：就如Genbank,Uniprot 就属于这种性质，想象一下全世界所有人的测序结果都要提交那里。如果你想知道你的基因是否有人研究过，也要到那里进行比较。其意义我就不说。
专业性：就如MASCOT, KEGG.我就业不多说了
拣便宜型：现在如果建立一个genbank第二，已经是没有意义的事情了，所以许多人开始捡便宜，我就给你举个例子（实际情况可能有误差） :韩国有一家网站，整理了Genbank里所有的16S rDNA,然后进行系统命名，我们都知道如果想知道一个细菌是那个种，必须要知道16S.换句话说你拿到你的菌株16S 就可以去他的网站比对了。哈哈，很简单不是吗。
编程 搂住看了不要晕：你不要想想象windows的那种大程序，动不动上万页纸。
比如从Genbank拿ABC transporter或任何逆向分析的基因家族来说吧：一小段代码：绝对不超过一页纸，就能让你拿到所有生物的基因。如果稍微补充一下代码（几句话），就能让你的代码每天/月去扫描一遍Genbank，如果有人提交到了genbank，你这里也能得到更新。这就是生物学。
当然我之举了一个例子，而且相当狭义，
生物学信息学的东西很多那。
就拿到你提到的药物卡发来说：
说神秘一点也不神秘：
比如你想开发一个针对马铃薯的除草剂。你手头上有个除草剂挺好，就是把马铃薯也搞死了。 你要研究一个新药物，能除草但是不能杀马铃薯。
于是你了解这个除草剂的成分，功能，靶蛋白（大多数除草剂都有靶蛋白如GABA）,当然你就能找到马铃薯的这个蛋白的序列。通过蛋白质建模工具，你就知道药物和蛋白的结合位点。通过调节药物的空间结构，比如添加一个羟基，增加一个苯环，使得该药物对马铃薯不是很敏感，这样你就目的就达到了，找个人合成这个化学物质，拿马铃薯试一试，效果不错，申请专利，效果不好，发表文章，效果很差，重新再来。 |
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