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汕头大学海洋科学接受调剂
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Andy8786

新虫 (初入文坛)

[交流] 【求助】求高手:怎样用Jade计算晶胞参数 已有4人参与

我现在做的催化剂是钙钛矿型催化剂,需要计算晶胞参数,不知道怎么算,希望高手指教一下,不胜感激!
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wyf7777

木虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
大家都很关注在Jade中如何进行晶胞修正的问题,实际上,晶胞修正和指标化是结合在一起的,因此,如果大家不是对已知晶系很有把握的话,最好在修正之前都预先进行指标化以判断或确证晶系。  

在指标化之前,大家有几项工作需预先进行,一是2theta校正(用标样即可);二是相分析,如果是二相甚至多项共存,则归属峰的时候要非常仔细。三是峰型拟合确定峰位(如果有重叠峰则更加必要);我个人认为,指标化最关键的一步是确定峰位,选取的峰最好是低角度的独立峰,而且选取的峰的数量并非多多益善,只要满足了不同的晶系要求即可,遇到重叠峰的时候一定要小心!   

做好上述工作之后,下一步就是options/pattern indexing,出现一个面板,在你的晶系前划勾,然后选择指标化方式,建议是从快(rapid  再下面有2 theat error一栏,如实填上即可,晶胞参数最大值最好填的大一点,其它的按默认,另外,对于一些做有机大分子晶体的朋友来说,晶胞密度可能比较重要,那就要把Z值和化学式输入,根据晶胞体积软件会自动给出的。  

完成上述步骤之后,就“go”吧,软件会按照一定的排列方式将很多种可能的结果一一列出来,fm值越小,结果的可信度就越高,有时会发现你认为正肯定确的空间群没有出现在结果中,不要紧,在"space group"旁边有一个'?',点击它一些,看看有没有找到,晶体学上,很多空间群都统属于同一点群,因此在指标化时,它们都是等同的。当你选取其中的一个指标化结果时,相应的就会在图谱上出现一系列黄色的指标化的衍射峰位,你可以一一与实际的衍射位对应,看看结果是否准确。有时一个结果也没有得到,有可能的原因是选取得峰不对,2theta偏差不对,选择的晶系不对,也有可能最大晶胞值太小,或者fm截取值太低的缘故。那就重新再来吧。  

接下来的事情就比较容易了,先选定正确的结果(蓝),点击“Refine”,出现“Cell Refinement”的控制面板,再点击Refine,你就可以得到精确的晶胞参数,esd表示的是标准偏差。   
如果你已知了空间群,并且选峰正确(手动),那么你也可以直接“options”/“Cell Refinement”/Refine,打开‘reflections',看看偏差多大,它可以作为指标化和晶胞修正的结果输出。
5楼2012-11-29 15:56:43
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yp_03

木虫 (正式写手)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
tangjy(金币+1):谢谢回帖交流 2010-10-16 16:18:20
用JADE的caculate lattice就可以了!
建议看看郭常霖得文献,自己动手计算
知道晶系得话应该比较好算得
软件都有一定得极限性
还有软件各种处理后得到得数据可能都不一样
最后自己都不知道那个是正确得
3楼2010-10-16 12:26:56
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wqs880703

木虫 (正式写手)

引用回帖:
1178314楼: Originally posted by yp_03 at 2010-10-16 12:26:56
用JADE的caculate lattice就可以了!
建议看看郭常霖得文献,自己动手计算
知道晶系得话应该比较好算得
软件都有一定得极限性
还有软件各种处理后得到得数据可能都不一样
最后自己都不知道那个是正确得

您好   正交晶系计算晶胞参数的公式是什么啊?谢谢
4楼2012-11-27 15:07:02
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