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【求助/交流】用MEGA4.0做进化树的问题
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zhang2101985
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[交流]
【求助/交流】用MEGA4.0做进化树的问题
已有12人参与
用MEGA做进化树的时候需要meg文件或者fas文件,这个怎么弄啊?
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1楼
2010-10-14 16:33:45
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cyz20050505
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小木虫(金币
+0.5
):给个红包,谢谢回帖交流
MEGA要是都像你们这样用,连老天都会哭泣的!!!你的序列不是在world里吗,你把他们复制粘贴在MEGA中的Alignment窗口里,然后就在里面运行内嵌的Clustal W程序进行比对,比对好后输出为MEGA格式,关掉这个窗口后,打开刚才在输出的MEGA文件,点击Phylogenetic analysis窗口进行简单的NJ,UOGMA,ME,MP分析。但是明确的告诉你,这样做只是粗略的,简单的,大概的一种方法,要是做的深,不建议用MEGA建树。
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11楼
2010-12-09 11:46:59
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1949stone
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Originally posted by
zhang2101985
at 2010-10-14 16:33:45:
用MEGA做进化树的时候需要meg文件或者fas文件,这个怎么弄啊?
mega自己也可以生成
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海纳百川止于至善
3楼
2010-10-14 19:11:24
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zhang2101985
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Originally posted by
1949stone
at 2010-10-14 19:11:24:
mega自己也可以生成
用mega怎么生成啊?我现在的序列是world里面的
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4楼
2010-10-16 08:52:47
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1949stone
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dhd997(金币+1):热心,鼓励。 2010-10-16 13:26:38
引用回帖:
Originally posted by
zhang2101985
at 2010-10-16 08:52:47:
用mega怎么生成啊?我现在的序列是world里面的
在txt里编辑 然后再对比 比对后可以生成meg打开的格式
或者直接保存成aln文件 然后再mega里转化
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海纳百川止于至善
5楼
2010-10-16 12:52:44
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