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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » 【求助成功】vasp5.2占很大内存，求解
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tsh8167

木虫 (小有名气)

[交流] 【求助成功】vasp5.2占很大内存，求解

求高人指点：
我在我的单机上编译vasp5.2串行版，编译成功后，运行时CPU利用率有时达到75％，但有时候又只有3％，而内存的占用率一直在85％附近，这是什么原因？有可以设置什么参数来内存的占用率，同时维持CPU利用率在80％以上？
我的配置：intel酷瑞双核E5200+2G内存+ubuntu9.04系统
vasp编译：intel ifort11.1+intel mkl10.2+intel BLAS
注：以前我在我的电脑上编译过vasp5.2，能算，也没有出现上述问题，当时怀疑vasp编译有错，就重新编译了一次，结果出现了这样的问题。

[ Last edited by tsh8167 on 2010-10-22 at 09:22 ]
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1楼 2010-10-13 10:05:06
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后天一

木虫 (小有名气)

我们的自由！
tsh8167(金币+1):感谢交流 2010-10-13 11:51:31
tsh8167(金币+1): 2010-10-22 09:19:46
是同一个任务不同阶段的CPU占用率不同吗？
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2楼2010-10-13 10:29:30
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quby7503

银虫 (著名写手)
★
ym23(金币+1):欢迎常来交流 2010-10-13 11:08:46
tsh8167(金币+1):感谢交流……但是我现在只能在我自己的单机上计算 2010-10-13 11:52:47
tsh8167(金币+1): 2010-10-22 09:19:50
2G内存太小了，我经常用到10G以上，CPU100％，如果放到4G内存的电脑上算，CPU就不到100％了
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3楼2010-10-13 11:03:00
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tsh8167

木虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by 后天一 at 2010-10-13 10:29:30:
是同一个任务不同阶段的CPU占用率不同吗？

是的，刚开始的时候CPU占用率很低，慢慢的就会达到75％，中间有时候还是会降到3％。
是不是跟KPOINT中k点网格的选取有关？现在我把k网格从6*6*6降到3*3*3的时候，又恢复正常了。
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4楼2010-10-13 11:51:01
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beyondstar

木虫 (正式写手)
★
ym23(金币+1):欢迎常来交流 2010-10-13 18:52:32
tsh8167(金币+1):谢谢交流…… 2010-10-15 15:40:27
tsh8167(金币+1): 2010-10-22 09:19:54
呵呵，你多少个原子，阶段能什么的，我觉得也可能是正常的现象。VASP快的原因一直就是把东西都弄到内存里了
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5楼2010-10-13 16:18:15
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贺仪

铁杆木虫 (著名写手)
★
zzy870720z(金币+1):谢谢提示 2010-10-14 19:39:17
tsh8167(金币+1):我用的就是vasp串行版啊！如4楼所问：内存的占用率是不是跟K网格的选取有很大关系？ 2010-10-15 09:53:33
tsh8167(金币+1): 2010-10-22 09:19:56
内存太小了 这样的话建议使用串行计算，vasp计算的内存和线程数约成正比的。还不行的话 只有改其他的 kpoints 和 NBAND PREC 等
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嘟啦啦嘟啦啦嘟
6楼2010-10-14 16:21:15
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netx_ray

木虫 (小有名气)
tsh8167(金币+1):谢谢提示…… 2010-10-15 09:51:05
tsh8167(金币+1): 2010-10-22 09:19:59
ubuntu 你即使不运行任何程序，时间久了，内存占用也会慢慢上去。不必担心这个。系统对于内存的使用方式与windows不同，内存里面缓存了一些东西。
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7楼2010-10-14 23:01:57
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