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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 【求助】利用MS建模
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tmj523397981

金虫 (初入文坛)

[交流] 【求助】利用MS建模

各位大侠，小弟急需用MS建模，请各位大侠指点指点，小弟不胜感激！

*data for   ICSD #40277
CopyRight   ?2008 by Fachinformationszentrum Karlsruhe, and the U.S. Secretary of
            Commerce on behalf of the United States.  All rights reserved.
Coll Code   40277
Rec  Date   1999/11/30
Mod  Date   2007/08/01
Chem Name   Magnesium Catena-silicate
Structured  Mg (Si O3)
Sum         Mg1 O3 Si1
ANX         ABX3
Min Name    Garnet
D(calc)     3.51
Title       Structure and twinning of single-crystal Mg Si O3 garnet synthetsized
            at 17 GPa and 1800 C
Author(s)   Angel, R.J.;Finger, L.W.;Hazen, R.M.;Kanzaki, M.;Weidner,
            D.J.;Liebermann, R.C.;Veblen, D.R.
Reference   American Mineralogist
            (1989), 74, 509-512
Unit Cell   11.501(1) 11.501(1) 11.480(2) 90. 90. 90.
Vol         1518.49
Z           32
Space Group I 41/a Z
SG Number   88
Cryst Sys   tetragonal
Pearson     tI160
Wyckoff     f8 e d c b a
R Value     .043
Red Cell    I  9.954 9.954 9.954 109.421 109.421 109.569 759.247
Trans Red   -0.500 0.500 0.500 / 0.500 -0.500 0.500 / 0.500 0.500 -0.500
Comments    Sign of z-values reversed to fit space group setting
            Compound with mineral name: Garnet
            The structure has been assigned a PDF number (experimental
            powder diffraction data): 47-1750
            Structure type : CdGeO3
            X-ray diffraction from single crystal
Atom  #   OX   SITE      x           y           z           SOF      H        ITF(B)   
Mg   1  +2    16 f  0.1253(4)   0.0112(4)   0.7413(8)      1.         0         1.33(8)
Mg   2  +2    8 e   0           0.25        0.3742(6)      1.         0         1.54(9)
Mg   3  +2    8 d   0           0           0.5            0.80(6)    0         0.22(3)
Si   1  +4    8 d   0           0           0.5            0.20(6)    0         0.22(3)
Mg   4  +2    8 c   0           0           0              0.20(6)    0         0.22(3)
Si   2  +4    8 c   0           0           0              0.80(6)    0         0.22(3)
Si   3  +4    4 b   0           0.25        0.625          1.         0        1.03(12)
Si   4  +4    4 a   0           0.25        0.125          1.         0        0.37(10)
Si   5  +4    16 f  0.1249(3)   0.0065(3)   0.2456(3)      1.         0         0.53(5)
O    1  -2    16 f  0.0282(6)   0.0550(6)   0.3367(6)      1.         0        0.88(12)
O    2  -2    16 f  0.0380(6)   -.0471(6)   0.1438(6)      1.         0        1.31(14)
O    3  -2    16 f  0.2195(7)   0.1023(6)   0.1979(6)      1.         0        1.28(14)
O    4  -2    16 f  0.2150(6)   -.0894(6)   0.3000(6)      1.         0        0.99(12)
O    5  -2    16 f  -.0588(6)   0.1617(6)   0.5320(6)      1.         0        0.89(12)
O    6  -2    16 f  -.1040(6)   0.2080(6)   0.2149(6)      1.         0        1.01(12)
*end for    ICSD #40277
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1楼 2010-10-09 21:46:41
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tmj523397981

金虫 (初入文坛)
重点是其中有几个坐标是重复的，我不知道这个怎么处理.
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11楼2010-10-09 23:20:13
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cash_ms

木虫 (正式写手)
★
tmj523397981(金币+3):谢谢参与
有了这些数据建模轻而易举了
赞一下(1人) 回复此楼
2楼2010-10-09 21:51:17
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cash_ms

木虫 (正式写手)
★ ★
tmj523397981(金币+3):谢谢参与
zxzj05(金币+1):奖励交流！ 2010-10-10 13:29:46
引用回帖:
Originally posted by tmj523397981 at 2010-10-09 21:46:41:
各位大侠，小弟急需用MS建模，请各位大侠指点指点，小弟不胜感激！

*data for   ICSD #40277
CopyRight   ?2008 by Fachinformationszentrum Karlsruhe, and the U.S. Secretary of
            C ...

有了空间群，晶格参数，原子坐标，就可以建模了
赞一下(2人) 回复此楼
3楼2010-10-09 21:52:16
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tmj523397981

金虫 (初入文坛)
Mg   3  +2    8 d   0           0           0.5            0.80(6)    0         0.22(3)
Si   1  +4    8 d   0           0           0.5            0.20(6)    0         0.22(3)
Mg   4  +2    8 c   0           0           0              0.20(6)    0         0.22(3)
Si   2  +4    8 c   0           0           0              0.80(6)    0         0.22(3)
本文来自: 小木虫论坛 http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=2471475&pid=966535&page=1#pid966535
主要就是这块不清楚
赞一下 回复此楼
4楼2010-10-09 22:36:55
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