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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Siesta&Smeagol&Atk » 【求助】编译siesta
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小木虫于

金虫 (正式写手)
★
ym23(金币+1):欢迎常来交流 2010-10-12 09:27:06
我是用的文件夹/test/transiesta/fast 中的文件进行测试的
arch.make
#
# This file is part of the SIESTA package.
#
# Copyright (c) Fundacion General Universidad Autonoma de Madrid:
# E.Artacho, J.Gale, A.Garcia, J.Junquera, P.Ordejon, D.Sanchez-Portal
# and J.M.Soler, 1996- .
#
# Use of this software constitutes agreement with the full conditions
# given in the SIESTA license, as signed by all legitimate users.
#
.SUFFIXES:
.SUFFIXES: .f .F .o .a .f90 .F90

SIESTA_ARCH=x86_64-redhat5-linux

FPP=
FPP_OUTPUT=
FC=mpif90
RANLIB=ranlib

SYS=nag

SP_KIND=4
DP_KIND=8
KINDS=$(SP_KIND) $(DP_KIND)

FFLAGS=-g -O2
FPPFLAGS= -DFC_HAVE_FLUSH -DFC_HAVE_ABORT -DMPI
LDFLAGS=-Vaxlib

ARFLAGS_EXTRA=

FCFLAGS_fixed_f=
FCFLAGS_free_f90=
FPPFLAGS_fixed_F=
FPPFLAGS_free_F90=

BLAS_LIBS=-L/opt/intel/mkl/10.0.1.014/lib/em64t -lmkl_solver_lp64 -lmkl_intel_lp64 -lguide
# -lmkl_intel_thread
LAPACK_LIBS=-L/opt/intel/mkl/10.0.1.014/lib/em64t -lmkl_sequential -lmkl_core  -lmkl_lapack
BLACS_LIBS=-L/opt/intel/mkl/10.0.1.014/lib/em64t -lmkl_blacs_lp64
SCALAPACK_LIBS=-L/opt/intel/mkl/10.0.1.014/lib/em64t -lmkl_scalapack_lp64

COMP_LIBS=

NETCDF_LIBS=
NETCDF_INTERFACE=

LIBS=$(SCALAPACK_LIBS) $(BLACS_LIBS) $(LAPACK_LIBS) $(BLAS_LIBS) $(NETCDF_LIBS)

#SIESTA needs an F90 interface to MPI
#This will give you SIESTA's own implementation
#If your compiler vendor offers an alternative, you may change
#to it here.
MPI_INTERFACE=libmpi_f90.a
MPI_INCLUDE=/usr/local/mpich2/include

#Dependency rules are created by autoconf according to whether
#discrete preprocessing is necessary or not.
.F.o:
        $(FC) -c $(FFLAGS) $(INCFLAGS) $(FPPFLAGS) $(FPPFLAGS_fixed_F)  $<
.F90.o:
        $(FC) -c $(FFLAGS) $(INCFLAGS) $(FPPFLAGS) $(FPPFLAGS_free_F90) $<
.f.o:
        $(FC) -c $(FFLAGS) $(INCFLAGS) $(FCFLAGS_fixed_f)  $<
.f90.o:
        $(FC) -c $(FFLAGS) $(INCFLAGS) $(FCFLAGS_free_f90)  $<
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11楼2010-10-10 18:42:11
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zhangguangping

木虫 (著名写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by 小木虫于 at 2010-10-10 11:42:11:
我是用的文件夹/test/transiesta/fast 中的文件进行测试的
arch.make
#
# This file is part of the SIESTA package.
#
# Copyright (c) Fundacion General Universidad Autonoma de Madrid:
# E.Artacho, ...

关于ifort+mkl+mpich2的组合，我虽然编译成功了，但是从来没有使用过。所以不敢说是不是由于这个组合的原因。但是我建议使用openmpi来编译。openmpi编译出来的计算也快。openmpi的下载地址：
http://www.open-mpi.org/software/ompi/v1.4/
建议用1.4（1.4.1或者1.4.3，我使用的是1.4.1）的稳定版本。先不要用1.5的新版本。
如果使用openmpi你的arch里面的blacs使用这个blacs_openmpi_lp64,否则计算的时候出错。
这个应该可以解决你的问题。

[ Last edited by zhangguangping on 2010-10-11 at 02:34 ]
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弘德明志博学笃行
12楼2010-10-11 09:32:08
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小木虫于

金虫 (正式写手)
多谢指点，我尝试一下。
赞一下 回复此楼
13楼2010-10-11 13:03:36
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