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hxy366

金虫 (小有名气)

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[交流] 【求助】各位高手如何整理高斯结果的？已有4人参与

想把结果中某些相同类型的信息复制到一起以便查看，手动操作很麻烦，有什么快点的方法没有？例如：优化过程中如果想把每次优化的收敛判定结果整理到一起以方便比较优化时的变化，如下：
Maximum Force          0.052228    0.000450    NO
RMS       Force          0.005206    0.000300    NO
Maximum Displacement    0.339187    0.001800    NO
RMS       Displacement    0.037789    0.001200    NO

Maximum Force          0.026208    0.000450    NO
RMS       Force          0.002725    0.000300    NO
Maximum Displacement    0.071226    0.001800    NO
RMS       Displacement    0.012833    0.001200    NO

Maximum Force          0.005001    0.000450    NO
RMS       Force          0.000729    0.000300    NO
Maximum Displacement    0.067965    0.001800    NO
RMS       Displacement    0.014147    0.001200    NO

高斯计算结果中有许多不想要的信息，怎么快速的把它们滤掉？
有什么好用的结果整理软件或操作方法，请高手们赐教，谢谢!

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1458238025==

1楼 2010-10-09 09:59:52

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emc2

金虫 (初入文坛)

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grep "[MR][aM]......[FD][oi]" XXX.log

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7楼2010-10-10 07:40:25

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pwzhou

铁杆木虫 (正式写手)

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zhou2009(金币+3): 2010-10-09 12:04:21

这个很简单，在Linux下用grep命令就可以实现：
grep -A 4 "Converged" $output

$output代表Gaussian输出文件的名称

顺便再提供一个脚本，这个脚本可以检测优化过程已经进行了几步以及当前的收敛状态：

CODE:

#!/bin/sh

if [ $# -ne 1 ]

then

        echo "Usage: $0 Gaussian output file"

        exit 1

fi

if [ ! -e $1 ]

then

        echo "$1 not existed!"

        exit 1

fi

scf_iters=`grep "Converged" $1 | wc -l`

echo ""

echo -e "The SCF has runned for \033[45m\033[5m $scf_iters \033[0m cycles"

echo ""

echo "The converged codition is:"

grep -A 4 "Converged" $1 | tail -4

echo ""

执行结果：

引用回帖:

Originally posted by hxy366 at 2010-10-09 09:59:52:
想把结果中某些相同类型的信息复制到一起以便查看，手动操作很麻烦，有什么快点的方法没有？例如：优化过程中如果想把每次优化的收敛判定结果整理到一起以方便比较优化时的变化，如下：
Maximum Force ...

[ Last edited by pwzhou on 2010-10-9 at 10:28 ]

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2楼2010-10-09 10:22:07

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